1b41

HUMAN ACETYLCHOLINESTERASE COMPLEXED WITH FASCICULIN-II, GLYCOSYLATED PROTEIN

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 75.1 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACETYLCHOLINESTERASE

Homo sapiens

UniProt P22303

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 4 其他聚合物 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 36–574 片段:SINGLE DOMAIN 突变:YES FASCICULIN-2 × 2 (P01403) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.2;pH 7.20 分辨率 2.76 Å R-free 0.265

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 77 个其他 PDB 条目、84 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACES_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–539; UniProt 36–574

FASCICULIN-2

物种未注明

UniProt P01403

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 4 其他聚合物 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–61 片段:SINGLE DOMAIN 突变:YES ACETYLCHOLINESTERASE × 2 (P22303) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.2;pH 7.20 分辨率 2.76 Å R-free 0.265

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 6 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TXF7_DENAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–61; UniProt 1–61

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1b41

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1b41
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1b41
沉积日期 deposition_date1999-01-05
结构标题 titleHUMAN ACETYLCHOLINESTERASE COMPLEXED WITH FASCICULIN-II, GLYCOSYLATED PROTEIN
关键词 keywordsSERINE ESTERASE, HUMAN-ACETYLCHOLINESTERASE, HYDROLASE, SNAKE TOXIN, HYDROLASE-TOXIN COMPLEX; HYDROLASE/TOXIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.83
回转半径 Rg (电子) rg_electron23.46
零角强度 I(0) i070255500.00
分子量 molecular_weight65657.0 kDa
排除体积 excluded_volume82135 ų
包络体积 envelope_volume93767 ų
水化壳体积 shell_volume32093 ų
包络直径 envelope_diameter78.3
壳层 Rg shell_rg31.81
包络 Rg envelope_rg23.65
形状 Rg shape_rg23.40
总 Rg total_rg24.54
总原子数 total_atoms4633
残基数 n_residues592
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax75.1
Rg (实空间) rg_real24.63
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.40
I(0) (实空间) i0_real7.0260e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.9050e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal24.68
I(0) (倒空间) i0_reciprocal70260000.0000
解质量估计 total_estimate0.9060
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary32.2
偏度 Skewness skewness0.106
峰度 Kurtosis kurtosis-0.484
角度范围 angular_range— – 0.3200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha14130000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.931; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.983; Smooth: 0.998

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1b41a_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.69 — alpha/beta-Hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.69.1 — alpha/beta-Hydrolases
家族 Family familyc.69.1.1 — Acetylcholinesterase-like
结构域编号 domain_idd1b41b_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.7 — Snake toxin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.7.1 — Snake toxin-like
家族 Family familyg.7.1.1 — Snake venom toxins

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1b41A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1820 — Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain
结构域编号 domain_id1b41B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)