SAXSdb — 1b44

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (B-POL SUBUNIT OF HEAT-LABILE ENTEROTOXIN)

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 22–124 链 E； UniProt 22–124 链 F； UniProt 22–124 链 G； UniProt 22–124 链 H； UniProt 22–124	片段：SUBUNIT B	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；pH 6	分辨率 3.30 Å R-free 0.255

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1B44	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1LTR CRYSTAL STRUCTURE OF THE B SUBUNIT OF HUMAN HEAT-LABILE ENTEROTOXIN FROM E. COLI CARRYING A PEPTIDE WITH ANTI-HSV ACTIVITY 提交 1998-07-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2 链 E 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2 链 F 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2 链 G 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2 链 H 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2	突变：N103K 突变：N103K 突变：N103K 突变：N103K 突变：N103K	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6	分辨率 3.04 Å R-free 0.217
1LTR CRYSTAL STRUCTURE OF THE B SUBUNIT OF HUMAN HEAT-LABILE ENTEROTOXIN FROM E. COLI CARRYING A PEPTIDE WITH ANTI-HSV ACTIVITY 提交 1998-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 D 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2 链 E 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2 链 F 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2 链 G 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2 链 H 22–123（102 aa）片段：SUBUNIT B-R2	突变：N103K 突变：N103K 突变：N103K 突变：N103K 突变：N103K	SO4 SULFATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6	分辨率 3.04 Å R-free 0.217
2O2L Crystal structure of human heat-labile enterotoxin in complex with a blood group A antigen analog 提交 2006-11-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 22–124（103 aa）链 E 22–124（103 aa）链 F 22–124（103 aa）链 G 22–124（103 aa）链 H 22–124（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.53 Å R-free 0.237
2O2L Crystal structure of human heat-labile enterotoxin in complex with a blood group A antigen analog 提交 2006-11-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 22–124（103 aa）链 J 22–124（103 aa）链 K 22–124（103 aa）链 L 22–124（103 aa）链 M 22–124（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.53 Å R-free 0.237

共 2 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ELBH_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–103； UniProt 22–124 作者链 E； PDB构建体 1–103； UniProt 22–124 作者链 F； PDB构建体 1–103； UniProt 22–124 作者链 G； PDB构建体 1–103； UniProt 22–124 作者链 H； PDB构建体 1–103； UniProt 22–124

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1b44
沉积日期 deposition_date	1999-01-04
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF THE B SUBUNIT OF HEAT-LABILE ENTEROTOXIN FROM E. COLI CARRYING A PEPTIDE WITH ANTI-HSV ACTIVITY
关键词 keywords	B SUBUNIT, HEAT-LABILE ENTEROTOXIN ANTI-HSV, TOXIN; TOXIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	24.51 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	23.19 Å
零角强度 I(0) i0	58249600.00
分子量 molecular_weight	59856.0 kDa
排除体积 excluded_volume	75163 Å³
包络体积 envelope_volume	87913 Å³
水化壳体积 shell_volume	30374 Å³
包络直径 envelope_diameter	69.6 Å
壳层 Rg shell_rg	31.03 Å
包络 Rg envelope_rg	23.03 Å
形状 Rg shape_rg	23.22 Å
总 Rg total_rg	23.93 Å
总原子数 total_atoms	4186
残基数 n_residues	531
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	71.8 Å
Rg (实空间) rg_real	24.32 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.25 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.8250e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.5580e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.37 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	58250000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9143
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	31.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.072
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.623
角度范围 angular_range	— – 0.3250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	31930000.0000
实空间数据点数 n_real_points	64
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.973; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.976

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_id	d1b44d_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.2 — Bacterial enterotoxins
家族 Family family	b.40.2.1 — Bacterial AB5 toxins, B-subunits

结构域编号 domain_id	d1b44e_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.2 — Bacterial enterotoxins
家族 Family family	b.40.2.1 — Bacterial AB5 toxins, B-subunits

结构域编号 domain_id	d1b44f_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.2 — Bacterial enterotoxins
家族 Family family	b.40.2.1 — Bacterial AB5 toxins, B-subunits

结构域编号 domain_id	d1b44g_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.2 — Bacterial enterotoxins
家族 Family family	b.40.2.1 — Bacterial AB5 toxins, B-subunits

结构域编号 domain_id	d1b44h_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.2 — Bacterial enterotoxins
家族 Family family	b.40.2.1 — Bacterial AB5 toxins, B-subunits

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	1b44D00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 —

结构域编号 domain_id	1b44E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 —

结构域编号 domain_id	1b44F00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 —

结构域编号 domain_id	1b44G00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 —

结构域编号 domain_id	1b44H00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 —

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8. 引用文献 (3)

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晶胞边长 a length_a	127.100 Å
晶胞边长 b length_b	127.100 Å
晶胞边长 c length_c	176.100 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	40

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	10.000 Å
R 因子 r_factor	0.2120
R_work r_work	0.2120
R_free r_free	0.2550

描述 description	PROTEIN (B-POL SUBUNIT OF HEAT-LABILE ENTEROTOXIN)
分子量 formula_weight	14293.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F,G,H
原子数 atom_count	4186

CRYSTAL STRUCTURE OF THE B SUBUNIT OF HEAT-LABILE ENTEROTOXIN FROM E. COLI CARRYING A PEPTIDE WITH ANTI-HSV ACTIVITY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (B-POL SUBUNIT OF HEAT-LABILE ENTEROTOXIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

8. 引用文献 (3)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Vibrio cholerae

fit	/app/data/saxs_computation/b4/1b44/1b44.fit
pddf	/app/data/pr_computation/b4/1b44/1b44.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/b4/1b44/1b44.dat