1b6t

PHOSPHOPANTETHEINE ADENYLYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH 3'-DEPHOSPHO-COA FROM ESCHERICHIA COLI

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 76.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (PHOSPHOPANTETHEINE ADENYLYLTRANSFERASE)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–159 链 B； UniProt 1–159	未记录	SO4 SULFATE ION × 9 COD DEPHOSPHO COENZYME A × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5；pH 5.	分辨率 1.80 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1B6T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5JBN Crystal Structure of Apo Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) from E. coli 提交 2016-04-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 18 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.25 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.45 Å R-free 0.182
6B7A Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-methyl-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2017-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWM 2-methyl-1H-benzimidazol-7-ol × 6 SO4 SULFATE ION × 15 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 CL CHLORIDE ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.99 Å R-free 0.199
6B7A Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-methyl-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWM 2-methyl-1H-benzimidazol-7-ol × 2 SO4 SULFATE ION × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 CL CHLORIDE ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.99 Å R-free 0.199
6B7A Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-methyl-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWM 2-methyl-1H-benzimidazol-7-ol × 24 SO4 SULFATE ION × 60 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 36 CL CHLORIDE ION × 12 POP PYROPHOSPHATE 2- × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.99 Å R-free 0.199
6B7A Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-methyl-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–159（159 aa）	未记录	CWM 2-methyl-1H-benzimidazol-7-ol × 3 SO4 SULFATE ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.99 Å R-free 0.199
6B7A Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-methyl-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWM 2-methyl-1H-benzimidazol-7-ol × 3 SO4 SULFATE ION × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.99 Å R-free 0.199
6B7B Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 5-methoxy-2-methyl-1H-indole 提交 2017-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWJ 5-methoxy-2-methyl-1H-indole × 6 SO4 SULFATE ION × 12 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 POP PYROPHOSPHATE 2- × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.98 Å R-free 0.197
6B7B Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 5-methoxy-2-methyl-1H-indole 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWJ 5-methoxy-2-methyl-1H-indole × 2 SO4 SULFATE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.98 Å R-free 0.197
6B7B Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 5-methoxy-2-methyl-1H-indole 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWJ 5-methoxy-2-methyl-1H-indole × 24 SO4 SULFATE ION × 48 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 24 POP PYROPHOSPHATE 2- × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.98 Å R-free 0.197
6B7C Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with N-((1,3-dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl)-5-methyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine 提交 2017-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWP N-[(1,3-dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl]-5-methyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine × 6 SO4 SULFATE ION × 12 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 POP PYROPHOSPHATE 2- × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.56 Å R-free 0.199
6B7C Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with N-((1,3-dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl)-5-methyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWP N-[(1,3-dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl]-5-methyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine × 2 SO4 SULFATE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.56 Å R-free 0.199
6B7C Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with N-((1,3-dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl)-5-methyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–159（159 aa）	未记录	CWP N-[(1,3-dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl]-5-methyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine × 3 SO4 SULFATE ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.56 Å R-free 0.199
6B7C Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with N-((1,3-dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl)-5-methyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWP N-[(1,3-dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl]-5-methyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine × 3 SO4 SULFATE ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 POP PYROPHOSPHATE 2- × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.56 Å R-free 0.199
6B7D Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine 提交 2017-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWG 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine × 3 SO4 SULFATE ION × 21 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 K POTASSIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.80 Å R-free 0.197
6B7D Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWG 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine × 1 SO4 SULFATE ION × 7 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.80 Å R-free 0.197
6B7D Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	CWG 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine × 12 SO4 SULFATE ION × 84 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 K POTASSIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.80 Å R-free 0.197
6B7D Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–159（159 aa）	未记录	CWG 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine × 3 SO4 SULFATE ION × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.80 Å R-free 0.197
6B7D Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 3-(4-chlorophenyl)-6-methoxy-4,5-dimethylpyridazine 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–159（159 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 15 K POTASSIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 1.80 Å R-free 0.197
6B7E Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-4-(5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl)-3,3-dimethylisochroman-1-one 提交 2017-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 21 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 CWA (4R)-4-[5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]-3,3-dimethyl-3,4-dihydro-1H-2-benzopyran-1-one × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
6B7E Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-4-(5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl)-3,3-dimethylisochroman-1-one 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 7 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CWA (4R)-4-[5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]-3,3-dimethyl-3,4-dihydro-1H-2-benzopyran-1-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
6B7E Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-4-(5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl)-3,3-dimethylisochroman-1-one 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 84 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 24 CWA (4R)-4-[5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]-3,3-dimethyl-3,4-dihydro-1H-2-benzopyran-1-one × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
6B7E Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-4-(5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl)-3,3-dimethylisochroman-1-one 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–159（159 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 9 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
6B7E Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-4-(5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl)-3,3-dimethylisochroman-1-one 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–159（159 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 12 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 CWA (4R)-4-[5-(difluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]-3,3-dimethyl-3,4-dihydro-1H-2-benzopyran-1-one × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
6B7F Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-3,3-dimethyl-4-(5-vinyl-1H-imidazol-1-yl)isochroman-1-one 提交 2017-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 12 POP PYROPHOSPHATE 2- × 3 K POTASSIUM ION × 3 CW4 (4R)-4-(5-ethenyl-1H-imidazol-1-yl)-3,3-dimethyl-3,4-dihydro-1H-2-benzopyran-1-one × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 2.56 Å R-free 0.208
6B7F Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-3,3-dimethyl-4-(5-vinyl-1H-imidazol-1-yl)isochroman-1-one 提交 2017-10-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 4 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 K POTASSIUM ION × 1 CW4 (4R)-4-(5-ethenyl-1H-imidazol-1-yl)-3,3-dimethyl-3,4-dihydro-1H-2-benzopyran-1-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.25 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.2 M POTASSIUM BROMIDE	分辨率 2.56 Å R-free 0.208
6CCK Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-3-(3-chlorophenyl)-3-((5-methyl-7-oxo-4,7-dihydro-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino)propanenitrile 提交 2018-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EXJ (3R)-3-(3-chlorophenyl)-3-[(5-methyl-7-oxo-6,7-dihydro[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino]propanenitrile × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.61 Å R-free 0.198
6CCK Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-3-(3-chlorophenyl)-3-((5-methyl-7-oxo-4,7-dihydro-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino)propanenitrile 提交 2018-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EXJ (3R)-3-(3-chlorophenyl)-3-[(5-methyl-7-oxo-6,7-dihydro[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino]propanenitrile × 24 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 24 MG MAGNESIUM ION × 24 SO4 SULFATE ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.61 Å R-free 0.198
6CCL Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 1-benzyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridine 提交 2018-02-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 2–159（158 aa）链 B 2–159（158 aa）	未记录	EXG 1-benzyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 6 SO4 SULFATE ION × 18 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.77 Å R-free 0.202
6CCL Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 1-benzyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridine 提交 2018-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 2–159（158 aa）链 B 2–159（158 aa）	未记录	EXG 1-benzyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 24 SO4 SULFATE ION × 72 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.77 Å R-free 0.202
6CCM Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-((3-bromobenzyl)amino)-5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one 提交 2018-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EXP 2-{[(3-bromophenyl)methyl]amino}-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(6H)-one × 3 SO4 SULFATE ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.79 Å R-free 0.202
6CCM Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-((3-bromobenzyl)amino)-5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one 提交 2018-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EXP 2-{[(3-bromophenyl)methyl]amino}-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(6H)-one × 12 SO4 SULFATE ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.79 Å R-free 0.202
6CCN Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-2,4-dihydroxy-N-(2-(4-hydroxy-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)-3,3-dimethylbutanamide 提交 2018-02-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 2–159（158 aa）链 B 2–159（158 aa）	未记录	EXS (2R)-2,4-dihydroxy-N-[2-(7-hydroxy-1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]-3,3-dimethylbutanamide × 6 SO4 SULFATE ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.87 Å R-free 0.196
6CCN Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with (R)-2,4-dihydroxy-N-(2-(4-hydroxy-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)-3,3-dimethylbutanamide 提交 2018-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 2–159（158 aa）链 B 2–159（158 aa）	未记录	EXS (2R)-2,4-dihydroxy-N-[2-(7-hydroxy-1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]-3,3-dimethylbutanamide × 24 SO4 SULFATE ION × 72	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.87 Å R-free 0.196
6CCO Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 3-((1S,2S)-2-(4-hydroxy-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)cyclopentyl)benzoic acid 提交 2018-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EXV 3-[(1S,2S)-2-(7-hydroxy-1H-benzimidazol-2-yl)cyclopentyl]benzoic acid × 3 SO4 SULFATE ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.82 Å R-free 0.211
6CCO Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 3-((1S,2S)-2-(4-hydroxy-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)cyclopentyl)benzoic acid 提交 2018-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EXV 3-[(1S,2S)-2-(7-hydroxy-1H-benzimidazol-2-yl)cyclopentyl]benzoic acid × 12 SO4 SULFATE ION × 72	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.82 Å R-free 0.211
6CCQ Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-(3-chlorophenethyl)-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2018-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EX7 2-[2-(3-chlorophenyl)ethyl]-1H-benzimidazol-7-ol × 6 SO4 SULFATE ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.92 Å R-free 0.221
6CCQ Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-(3-chlorophenethyl)-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2018-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EX7 2-[2-(3-chlorophenyl)ethyl]-1H-benzimidazol-7-ol × 24 SO4 SULFATE ION × 72	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.92 Å R-free 0.221
6CCS Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-(trifluoromethyl)-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2018-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EXD 2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-7-ol × 6 SO4 SULFATE ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.06 Å R-free 0.219
6CCS Crystal structure of E.coli Phosphopantetheine Adenylyltransferase (PPAT/CoaD) in complex with 2-(trifluoromethyl)-1H-benzo[d]imidazol-4-ol 提交 2018-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	EXD 2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-7-ol × 24 SO4 SULFATE ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.06 Å R-free 0.219
6CHL Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with (R)-3-(3-chlorophenyl)-3-((5-methyl-7-oxo-4,7-dihydro-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino)propanenitrile 提交 2018-02-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 2–159（158 aa）链 B 2–159（158 aa）	未记录	EXJ (3R)-3-(3-chlorophenyl)-3-[(5-methyl-7-oxo-6,7-dihydro[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino]propanenitrile × 6 SO4 SULFATE ION × 21 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.20 Å R-free 0.218
6CHL Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with (R)-3-(3-chlorophenyl)-3-((5-methyl-7-oxo-4,7-dihydro-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino)propanenitrile 提交 2018-02-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 2–159（158 aa）链 B 2–159（158 aa）	未记录	EXJ (3R)-3-(3-chlorophenyl)-3-[(5-methyl-7-oxo-6,7-dihydro[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino]propanenitrile × 24 SO4 SULFATE ION × 84 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.20 Å R-free 0.218
6CHM Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with N-(2-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)ethyl)pivalamide 提交 2018-02-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F1V N-[2-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)ethyl]-2,2-dimethylpropanamide × 6 SO4 SULFATE ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.28 Å R-free 0.220
6CHM Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with N-(2-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)ethyl)pivalamide 提交 2018-02-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F1V N-[2-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)ethyl]-2,2-dimethylpropanamide × 24 SO4 SULFATE ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.28 Å R-free 0.220
6CHN Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with methyl (R)-4-(3-(2-cyano-1-((5-methyl-7-oxo-4,7-dihydro-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino)ethyl)phenoxy)piperidine-1-carboxylate 提交 2018-02-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F1D methyl 4-(3-{(1R)-2-cyano-1-[(5-methyl-7-oxo-6,7-dihydro[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino]ethyl}phenoxy)piperidine-1-carboxylate × 6 SO4 SULFATE ION × 15 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.03 Å R-free 0.199
6CHN Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with methyl (R)-4-(3-(2-cyano-1-((5-methyl-7-oxo-4,7-dihydro-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino)ethyl)phenoxy)piperidine-1-carboxylate 提交 2018-02-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F1D methyl 4-(3-{(1R)-2-cyano-1-[(5-methyl-7-oxo-6,7-dihydro[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino]ethyl}phenoxy)piperidine-1-carboxylate × 24 SO4 SULFATE ION × 60 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 12 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.03 Å R-free 0.199
6CHO Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with (R)-2-((1-(3-(4-methoxyphenoxy)phenyl)ethyl)amino)-5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one 提交 2018-02-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F14 2-({(1R)-1-[3-(4-methoxyphenoxy)phenyl]ethyl}amino)-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(6H)-one × 6 SO4 SULFATE ION × 18 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.85 Å R-free 0.203
6CHO Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with (R)-2-((1-(3-(4-methoxyphenoxy)phenyl)ethyl)amino)-5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one 提交 2018-02-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F14 2-({(1R)-1-[3-(4-methoxyphenoxy)phenyl]ethyl}amino)-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(6H)-one × 24 SO4 SULFATE ION × 72 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 48	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.85 Å R-free 0.203
6CHP Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with methyl (R)-4-(3-(2-cyano-1-((5-methyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-yl)amino)ethyl)benzyl)piperidine-1-carboxylate 提交 2018-02-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F0Y methyl 4-[(3-{(1R)-2-cyano-1-[(5-methyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-yl)amino]ethyl}phenyl)methyl]piperidine-1-carboxylate × 6 SO4 SULFATE ION × 15 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.94 Å R-free 0.197
6CHP Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with methyl (R)-4-(3-(2-cyano-1-((5-methyl-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-yl)amino)ethyl)benzyl)piperidine-1-carboxylate 提交 2018-02-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F0Y methyl 4-[(3-{(1R)-2-cyano-1-[(5-methyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-yl)amino]ethyl}phenyl)methyl]piperidine-1-carboxylate × 24 SO4 SULFATE ION × 60 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.94 Å R-free 0.197
6CHQ Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with 2-benzyl-N-(3-chloro-4-methylphenyl)-5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine 提交 2018-02-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F0V 2-benzyl-7-[(3-chloro-4-methylphenyl)amino]-5-methyl-3H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-8-ium × 3 SO4 SULFATE ION × 15 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.79 Å R-free 0.192
6CHQ Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with 2-benzyl-N-(3-chloro-4-methylphenyl)-5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine 提交 2018-02-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F0V 2-benzyl-7-[(3-chloro-4-methylphenyl)amino]-5-methyl-3H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-8-ium × 12 SO4 SULFATE ION × 60 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 24 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 1.79 Å R-free 0.192
6CKW Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with (R)-3-((7-(((S)-2-amino-2-(2-methoxyphenyl)ethyl)amino)-5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino)-3-(3-chlorophenyl)propanenitrile 提交 2018-03-01	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F6D (3R)-3-[(7-{[(2S)-2-amino-2-(2-methoxyphenyl)ethyl]amino}-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino]-3-(3-chlorophenyl)propanenitrile × 6 SO4 SULFATE ION × 27 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.06 Å R-free 0.187
6CKW Phosphopantetheine adenylyltransferase (CoaD) in complex with (R)-3-((7-(((S)-2-amino-2-(2-methoxyphenyl)ethyl)amino)-5-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino)-3-(3-chlorophenyl)propanenitrile 提交 2018-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–159（159 aa）链 B 1–159（159 aa）	未记录	F6D (3R)-3-[(7-{[(2S)-2-amino-2-(2-methoxyphenyl)ethyl]amino}-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)amino]-3-(3-chlorophenyl)propanenitrile × 24 SO4 SULFATE ION × 108 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 48 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium thiocyanate, 0.2 M potassium bromide	分辨率 2.06 Å R-free 0.187

共 21 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COAD_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 B； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1b6t
沉积日期 deposition_date	1999-01-18
结构标题 title	PHOSPHOPANTETHEINE ADENYLYLTRANSFERASE IN COMPLEX WITH 3'-DEPHOSPHO-COA FROM ESCHERICHIA COLI
关键词 keywords	COENZYME A BIOSYNTHESIS, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.13 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	21.31 Å
零角强度 I(0) i0	23264600.00
分子量 molecular_weight	36126.0 kDa
排除体积 excluded_volume	44987 Å³
包络体积 envelope_volume	52514 Å³
水化壳体积 shell_volume	21315 Å³
包络直径 envelope_diameter	80.5 Å
壳层 Rg shell_rg	27.53 Å
包络 Rg envelope_rg	21.65 Å
形状 Rg shape_rg	21.31 Å
总 Rg total_rg	22.12 Å
总原子数 total_atoms	2531
残基数 n_residues	314
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	76.9 Å
Rg (实空间) rg_real	22.21 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.54 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.3260e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.1760e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.20 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	23260000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8499
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	75.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.502
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.066
角度范围 angular_range	— – 0.3600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5070000.0000
实空间数据点数 n_real_points	68
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.722; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.913; Smooth: 0.963

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOSPHOPANTETHEINE ADENYLYLTRANSFERASE)
分子量 formula_weight	17859.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2853

MQKRAIYPGTFDPITNGHIDIVTRATQMFDHVILAIAASPSKKPMFTLEERVALAQQATAHLGNVEVVGFSDLMANFARNQHATVLIRGLRAVADFEYEMQLAHMNRHLMPELESVFLMPSKEWSFISSSLVKEVARHQGDVTHFLPENVHQALMAKLA

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	DEPHOSPHO COENZYME A
分子量 formula_weight	687.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	322

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1b6ta_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.1 — Nucleotidylyl transferase
家族 Family family	c.26.1.3 — Adenylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1b6tb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.26 — Adenine nucleotide alpha hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.26.1 — Nucleotidylyl transferase
家族 Family family	c.26.1.3 — Adenylyltransferase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1b6tA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

结构域编号 domain_id	1b6tB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — HUPs

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	135.500 Å
晶胞边长 b length_b	135.500 Å
晶胞边长 c length_c	135.500 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	I 2 3
空间群编号 int_tables_number	197
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.800 Å
最低分辨率 resolution_low	23.960 Å
R 因子 r_factor	0.2220
R_work r_work	0.2050
R_free r_free	0.2350

fit	/app/data/saxs_computation/b6/1b6t/1b6t.fit
pddf	/app/data/pr_computation/b6/1b6t/1b6t.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/b6/1b6t/1b6t.dat