1bhr

2'-DEOXY-ISOGUANOSINE BASE PAIRED TO THYMIDINE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE

Method: SOLUTION NMR Dmax: 47.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 聚集状态 实体与构建体证据 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 纯核酸 不含蛋白 蛋白 0 / DNA 2 / RNA 0 / 其他聚合物 0 PDB 声明:dimeric 实体 1:;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*IGUP*AP*AP*TP*TP*TP*GP*CP*G)-3') ; × 2 缺少 UniProt 身份时不显示参考序列区间 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 7;275 K 分辨率未提供

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1bhr

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1bhr
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bhr
沉积日期 deposition_date1998-06-10
结构标题 title2'-DEOXY-ISOGUANOSINE BASE PAIRED TO THYMIDINE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
关键词 keywordsDEOXYRIBONUCLEIC ACID, ISOGUANOSINE-THYMIDINE MISMATCH, DNA; DNA
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier13.71
回转半径 Rg (电子) rg_electron13.23
零角强度 I(0) i02757680.00
分子量 molecular_weight7343.0 kDa
排除体积 excluded_volume7127 ų
包络体积 envelope_volume9748 ų
水化壳体积 shell_volume7054 ų
包络直径 envelope_diameter47.4
壳层 Rg shell_rg17.18
包络 Rg envelope_rg13.43
形状 Rg shape_rg13.11
总 Rg total_rg13.98
总原子数 total_atoms762
残基数 n_residues22
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax47.2
Rg (实空间) rg_real13.79
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.44
I(0) (实空间) i0_real2.7580e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1560e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal13.78
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2758000.0000
解质量估计 total_estimate0.8561
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary13.2
偏度 Skewness skewness0.409
峰度 Kurtosis kurtosis-0.432
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha242100.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.804; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.737; Smooth: 0.978

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)