1bmo

BM-40, FS/EC DOMAIN PAIR

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BM-40

Homo sapiens

UniProt P09486

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 同源多聚体 蛋白 2 其他聚合物 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CALCIUM ION × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SPRC_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–233; UniProt 71–303 作者链 B; PDB构建体 1–233; UniProt 71–303

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bmo
沉积日期 deposition_date1997-03-25
结构标题 titleBM-40, FS/EC DOMAIN PAIR
关键词 keywordsEXTRACELLULAR MODULE, GLYCOPROTEIN, ANTI-ADHESIVE PROTEIN; EXTRACELLULAR MODULE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1bmo__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1bmo__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1bmo__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)32.67 Å
Rg(电子密度)33.45 Å
总 Rg33.51 Å
原子数3854
残基数466
排除体积68380 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1bmo__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1bmoa1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.3 — Osteonectin
结构域编号 domain_idd1bmoa2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.3 — Knottins (small inhibitors, toxins, lectins)
超家族 Superfamily superfamilyg.3.11 — EGF/Laminin
家族 Family familyg.3.11.3 — Follistatin (FS) module N-terminal domain, FS-N
结构域编号 domain_idd1bmoa3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like
结构域编号 domain_idd1bmob1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.3 — Osteonectin
结构域编号 domain_idd1bmob2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.3 — Knottins (small inhibitors, toxins, lectins)
超家族 Superfamily superfamilyg.3.11 — EGF/Laminin
家族 Family familyg.3.11.3 — Follistatin (FS) module N-terminal domain, FS-N
结构域编号 domain_idd1bmob3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1bmoA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id1bmoA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id1bmoB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id1bmoB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
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7. 引用文献 (4)