1bwm

A SINGLE-CHAIN T CELL RECEPTOR

Method: SOLUTION NMR Dmax: 69.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 聚集状态 实体与构建体证据 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 / DNA 0 / RNA 0 / 其他聚合物 0 PDB 声明:monomeric 实体 1:PROTEIN (ALPHA-BETA T CELL RECEPTOR (TCR) (D10)) × 1 缺少 UniProt 身份时不显示参考序列区间 实体 1片段:VARIABLE DOMAINS FROM ALPHA AND BETA CHAINS 实体 1突变:C415S 未记录非水小分子 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20 mM SODIUM ACETATE;压力 1 分辨率未提供

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1bwm

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1bwm
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bwm
沉积日期 deposition_date1998-09-23
结构标题 titleA SINGLE-CHAIN T CELL RECEPTOR
关键词 keywordsIMMUNOGLOBULIN, IMMUNORECEPTOR, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.17
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.66
零角强度 I(0) i02473810000.00
分子量 molecular_weight404170.0 kDa
排除体积 excluded_volume498120 ų
包络体积 envelope_volume92417 ų
水化壳体积 shell_volume30890 ų
包络直径 envelope_diameter79.6
壳层 Rg shell_rg32.52
包络 Rg envelope_rg25.50
形状 Rg shape_rg19.63
总 Rg total_rg19.99
总原子数 total_atoms55635
残基数 n_residues3735
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax69.2
Rg (实空间) rg_real20.14
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.55
I(0) (实空间) i0_real2.4740e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.4450e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.14
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2474000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8004
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary23.7
偏度 Skewness skewness0.311
峰度 Kurtosis kurtosis-0.283
角度范围 angular_range— – 0.3950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha2924000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.807; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1bwma1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)
结构域编号 domain_idd1bwma2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1bwmA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1bwmA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)