PARATHYROID HORMONE-RELATED PROTEIN
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 37–70 | 片段:RESIDUES 1-34 | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 5.1;277 K;离子强度(mmCIF原始值)550mM;压力 10E+5PA NMR样品组成:H2O/D2O (9:1) | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1BZG | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1M5N Crystal structure of HEAT repeats (1-11) of importin b bound to the non-classical NLS(67-94) of PTHrP 提交 2002-07-09 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 Q
103–130(28 aa)
片段:Residues 67-94
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;298 K;MES, PEG 4000, sodium chloride, Tween, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K, pH 6.00
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.297 |
| 3FFD Structure of parathyroid hormone-related protein complexed to a neutralizing monoclonal antibody 提交 2008-12-03 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 P
37–144(108 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.7;295 K;PEG 400, TRIS, pH 8.70, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 3H3G Crystal structure of the extracellular domain of the human parathyroid hormone receptor (PTH1R) in complex with parathyroid hormone-related protein (PTHrP) 提交 2009-04-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
48–70(23 aa)
片段:residues 12-34
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;7.5% PEG 2000, 13% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.233 |
| 7UZO Parathyroid hormone 1 receptor extracellular domain complexed with a peptide ligand containing one beta-amino acid 提交 2022-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
51–72(22 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;28 % v/v PEG Smear Low, 0.1 M tris-HCl pH 8, 0.15 M Sodium citrate, 1% ethylene glycol, 0.4 mM ZnSO4
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.182 |
| 7VVJ PTHrP-bound human PTH1R in complex with Gs 提交 2021-11-06 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 P
37–72(36 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8D51 Parathyroid hormone 1 receptor extracellular domain complexed with a peptide ligand containing beta-3-homotryptophan 提交 2022-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
51–72(22 aa)
|
突变:I31 substituted with beta-3-tryptophan 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;28 % v/v PEG Smear Low, 0.1 M tris-HCl pH 8, 0.15 M Sodium citrate, 1% ethylene glycol, 1 mM ZnSO4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 8D52 Parathyroid hormone 1 receptor extracellular domain complexed with a peptide ligand containing (2-naphthyl)-beta-3-homoalanine 提交 2022-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
51–72(22 aa)
|
突变:I31 substituted by (2-naphthyl)-beta-3-homoalanine 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;293 K;28 % v/v PEG Smear Low, 0.1 M tris-HCl pH 8, 0.15 M Sodium citrate, 1% ethylene glycol, 1 mM ZnSO4
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.244 |
| 8FLR Human PTH1R in complex with PTHrP and Gs 提交 2022-12-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 P
37–72(36 aa)
片段:UNP residues 37-72
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Buffer also contained 2 micromolar PTHrP peptide.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.94 Å |
| 8HAF PTHrP-PTH1R-Gs complex 提交 2022-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 P
37–72(36 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PLM PALMITIC ACID × 11 CLR CHOLESTEROL × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | PTHR_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–34; UniProt 37–70 |