1c8h
CANINE PARVOVIRUS STRAIN D EMPTY CAPSID STRUCTURE AT PH 5.5
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。
七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。
当前条目的 assembly 组成
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 60 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 1 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 5 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 4 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 6 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 5 | 蛋白单体 | 单体 | 1 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 6 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 120 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1c8h |
| 沉积日期 deposition_date | 2000-05-05 |
| 结构标题 title | CANINE PARVOVIRUS STRAIN D EMPTY CAPSID STRUCTURE AT PH 5.5 |
| 关键词 keywords | beta barrel, viral capsid, icosahedral symmetry, Icosahedral virus, Virus; VIRUS |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1c8h__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1c8h__assembly_1__model_1 | I(q)
1c8h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 0.00 Å |
| Rg（电子密度） | 110.80 Å |
| 总 Rg | 111.00 Å |
| 原子数 | 259260 |
| 残基数 | 32640 |
| 排除体积 | 4570600 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1c8h__assembly_1__model_1 |
complete icosahedral assembly （60） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 1c8h__assembly_2__model_1 |
monomeric （1） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 3 | 1 | 1c8h__assembly_3__model_1 |
pentameric （5） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 4 | 1 | 1c8h__assembly_4__model_1 |
hexameric （6） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 5 | 1 | 1c8h__assembly_5__model_1 |
monomeric （1） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 6 | 1 | 1c8h__assembly_6__model_1 |
120-meric （120） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains
SCOP 2.08 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1c8ha_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins) |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.121.5 — ssDNA viruses |
| 家族 Family family | b.121.5.2 — Parvoviridae-like VP |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1c8hA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 170 — Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 30 — Empty Capsid Viral Protein 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Parvovirus coat protein VP1/VP2 |