SAXSdb — 1cag

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly	聚集状态	实体与构建体证据	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 3 / DNA 0 / RNA 0 / 其他聚合物 0 PDB 声明：trimeric	实体 1：COLLAGEN-LIKE PEPTIDE × 3 缺少 UniProt 身份时不显示参考序列区间	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACY ACETIC ACID × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 1.85 Å

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1cag
沉积日期 deposition_date	1994-03-29
结构标题 title	CRYSTAL AND MOLECULAR STRUCTURE OF A COLLAGEN-LIKE PEPTIDE AT 1.9 ANGSTROM RESOLUTION
关键词 keywords	COLLAGEN; COLLAGEN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.93 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	24.23 Å
零角强度 I(0) i0	1413830.00
分子量 molecular_weight	8340.0 kDa
排除体积 excluded_volume	10405 Å³
包络体积 envelope_volume	13333 Å³
水化壳体积 shell_volume	6648 Å³
包络直径 envelope_diameter	88.8 Å
壳层 Rg shell_rg	23.50 Å
包络 Rg envelope_rg	25.06 Å
形状 Rg shape_rg	24.22 Å
总 Rg total_rg	24.12 Å
总原子数 total_atoms	589
残基数 n_residues	58
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	91.2 Å
Rg (实空间) rg_real	23.73 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.58 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4140e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2680e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	23.54 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1414000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6199
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	11.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.697
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.313
角度范围 angular_range	— – 0.3450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	36910.0000
实空间数据点数 n_real_points	66
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.024; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.003; Smooth: 0.987

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_id	d1caga1
类 Class class	k — Designed proteins
折叠类型 Fold fold	k.3 — Collagen-like peptides
超家族 Superfamily superfamily	k.3.1 — Collagen-like peptides
家族 Family family	k.3.1.1 — Collagen-like peptides

结构域编号 domain_id	d1caga2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1caga3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1cagb1
类 Class class	k — Designed proteins
折叠类型 Fold fold	k.3 — Collagen-like peptides
超家族 Superfamily superfamily	k.3.1 — Collagen-like peptides
家族 Family family	k.3.1.1 — Collagen-like peptides

结构域编号 domain_id	d1cagb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1cagb3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1cagc1
类 Class class	k — Designed proteins
折叠类型 Fold fold	k.3 — Collagen-like peptides
超家族 Superfamily superfamily	k.3.1 — Collagen-like peptides
家族 Family family	k.3.1.1 — Collagen-like peptides

结构域编号 domain_id	d1cagc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1cagc3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	173.460 Å
晶胞边长 b length_b	14.057 Å
晶胞边长 c length_c	25.308 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.82 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.850 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	0.1970
R_work r_work	0.1970
R_free r_free	—

描述 description	COLLAGEN-LIKE PEPTIDE
分子量 formula_weight	2704.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	674

CRYSTAL AND MOLECULAR STRUCTURE OF A COLLAGEN-LIKE PEPTIDE AT 1.9 ANGSTROM RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目的 assembly 组成

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

描述 description	ACETIC ACID
分子量 formula_weight	60.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	85

fit	/app/data/saxs_computation/ca/1cag/1cag.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ca/1cag/1cag.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ca/1cag/1cag.dat