1d42

SOLUTION STRUCTURE OF [D(GTATATAC)]2 VIA RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS WITH NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE CONSTRAINTS DERIVED FROM RELAXATION MATRIX ANALYSIS OF TWO-DIMENSIONAL NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT EXPERIMENTS

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 纯核酸 不含蛋白 0 / 2 / 0 / 0 与全部聚合物一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1d42
沉积日期 deposition_date1991-05-15
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF [D(GTATATAC)]2 VIA RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS WITH NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE CONSTRAINTS DERIVED FROM RELAXATION MATRIX ANALYSIS OF TWO-DIMENSIONAL NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT EXPERIMENTS
关键词 keywordsDNA; DNA
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1d42__assembly_1__model_2

Assembly 1 · Model 2 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1d42__assembly_1__model_2 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1d42__assembly_1__model_2 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)11.09 Å
Rg(电子密度)10.15 Å
总 Rg11.32 Å
原子数322
残基数16
排除体积4758 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1d42__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1d42__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1d42__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1d42__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1d42__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

7. 引用文献 (2)