COPPER AMINE OXIDASE
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 31–757 链 B; UniProt 31–757 | 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 HY1 PHENYLACETALDEHYDE × 2 NO NITRIC OXIDE × 2 PEA 2-PHENYLETHYLAMINE × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;291 K;sodium citrate, HEPES buffer, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 18K | 分辨率 2.40 Å R-free 0.231 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1D6Y | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D6U CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI AMINE OXIDASE ANAEROBICALLY REDUCED WITH BETA-PHENYLETHYLAMINE 提交 1999-10-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 HY1 PHENYLACETALDEHYDE × 2 PEA 2-PHENYLETHYLAMINE × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;291 K;SODIUM CITRATE, HEPES BUFFER, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 1D6Z CRYSTAL STRUCTURE OF THE AEROBICALLY FREEZE TRAPPED RATE-DETERMINING CATALYTIC INTERMEDIATE OF E. COLI COPPER-CONTAINING AMINE OXIDASE. 提交 1999-10-16 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 HY1 PHENYLACETALDEHYDE × 2 PEO HYDROGEN PEROXIDE × 2 PEA 2-PHENYLETHYLAMINE × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;291 K;sodium citrate, HEPES buffer, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 1DYU The active site base controls cofactor reactivity in Escherichia coli amine oxidase: X-ray crystallographic studies with mutational variants. 提交 2000-02-08 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.1;1.2 M SODIUM CITRATE, 0.1 M HEPES PH 7.1
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.237 |
| 1JRQ X-ray Structure Analysis of the Role of the Conserved Tyrosine-369 in Active Site of E. coli Amine Oxidase 提交 2001-08-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
突变:Y369F 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:Y369F 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;291 K;SODIUM CITRATE, HEPES BUFFER, pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.235 |
| 1LVN CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI AMINE OXIDASE COMPLEXED WITH TRANYLCYPROMINE 提交 2002-05-28 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Sitting drop;pH 7.2;291 K;1.3M SODIUM CITRATE, 0.1M HEPES BUFFER, pH 7.2,
INHIBITOR SOAKING SOLUTION 10:1 RATIO OF RACEMIC
TRANYLCYPROMINE TO ENZYME MADE UP IN 1.4M SODIUM
CITRATE, 0.1M HEPES BUFFER, PH 7.2. CRYSTAL SOAKED
FOR 20 DAYS.CRYOPROTECTANT 20% GLYCEROL, 1.4M
SODIUM CITRATE BUFFER, PH 7.2, pH 7.20, Sitting drop, temperature 291.0K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.229 |
| 1OAC CRYSTAL STRUCTURE OF A QUINOENZYME: COPPER AMINE OXIDASE OF ESCHERICHIA COLI AT 2 ANGSTROEMS RESOLUTION 提交 1995-09-27 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1QAF THE ACTIVE SITE BASE CONTROLS COFACTOR REACTIVITY IN ESCHERICHIA COLI AMINE OXIDASE : X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES WITH MUTATIONAL VARIANTS 提交 1999-03-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
36–756(721 aa)
链 B
36–756(721 aa)
|
突变:D383E 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:D383E 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.1;315 K;VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
PH 7.1, 315 K
SODIUM CITRATE, HEPES
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.244 |
| 1QAK THE ACTIVE SITE BASE CONTROLS COFACTOR REACTIVITY IN ESCHERICHIA COLI AMINE OXIDASE : X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES WITH MUTATIONAL VARIANTS 提交 1999-03-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
36–757(722 aa)
链 B
36–757(722 aa)
|
突变:D383A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:D383A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.1;pH 7.1
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 1QAL THE ACTIVE SITE BASE CONTROLS COFACTOR REACTIVITY IN ESCHERICHIA COLI AMINE OXIDASE : X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES WITH MUTATIONAL VARIANTS 提交 1999-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
36–756(721 aa)
链 B
36–756(721 aa)
|
突变:D383N 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:D383N 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.1;315 K;VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, PH 7.1, 315K, 1.2 M SODIUM CITRATE, 0.1 M HEPES
CRYOPROTECTANT 1.4 M SODIUM CITRATE 0.1M HEPES 20% GLYCEROL
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.241 |
| 1SPU STRUCTURE OF OXIDOREDUCTASE 提交 1996-11-13 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.2;1.4M SODIUM CITRATE, 0.1M HEPES BUFFER, PH 7.2 PROTEIN SOLUTION CONCENTRATION 6.5 MG/ML INHIBITOR SOAKING SOLUTION 0.375MM 2-HYDRAZINOPYRIDINE MADE UP IN 1.4M SODIUM CITRATE, 0.1M HEPES BUFFER, PH 7.2. CRYSTAL SOAKED FOR 30 DAYS. CRYOPROTECTANT 20% GLYCEROL, 1.44M SODIUM CITRATE BUFFER, PH 6.4
|
分辨率 2.00 Å |
| 2W0Q E. coli copper amine oxidase in complex with Xenon 提交 2008-08-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 XE XENON × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.1;100MM HEPES, PH 7.1, 1.2 M SODIUM CITRATE
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.219 |
| 2WGQ Zinc substituted E Coli Copper Amine Oxidase, a model for the precursor for 2,4,5-trihydroxyphenylalaninequinone formation 提交 2009-04-23 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.264 |
| 2WO0 EDTA treated E. coli copper amine oxidase 提交 2009-07-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
片段:RESIDUES 31-757
链 B
31–757(727 aa)
片段:RESIDUES 31-757
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.248 |
| 2WOF EDTA treated E. coli copper amine oxidase 提交 2009-07-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.25 Å R-free 0.220 |
| 2WOH Strontium soaked E. coli copper amine oxidase 提交 2009-07-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 SR STRONTIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.70 Å R-free 0.243 |
| 6EZZ Crystal structure of Escherichia coli amine oxidase mutant E573Q 提交 2017-11-16 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
31–757(727 aa)
链 B
31–757(727 aa)
|
突变:E573Q 突变:E573Q | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 9 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;1.6 M Sodium citrate, 100mM HEPES pH 6-7
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.197 |
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| UniProt名称 | AMO_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–727; UniProt 31–757 作者链 B; PDB构建体 1–727; UniProt 31–757 |