SAXSdb — 1d8a

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ENOYL-[ACYL-CARRIER-PROTEIN] REDUCTASE

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–262 链 B； UniProt 2–262	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 TCL TRICLOSAN × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOUR DIFFUSION；pH 7.5；290 K；PEG 400, NA HEPES, AMMONIUM SULPHATE, pH 7.5, VAPOUR DIFFUSION, temperature 290K	分辨率 2.20 Å R-free 0.294

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1D8A	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1C14 CRYSTAL STRUCTURE OF E COLI ENOYL REDUCTASE-NAD+-TRICLOSAN COMPLEX 提交 1999-07-20	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–262（262 aa）链 B 1–262（262 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 TCL TRICLOSAN × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；300 K；(NH4)2SO4, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.00 Å R-free 0.263
1DFG X-RAY STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI ENOYL REDUCTASE WITH BOUND NAD AND BENZO-DIAZABORINE 提交 1997-01-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–261（261 aa）链 B 1–261（261 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 NDT 2-(TOLUENE-4-SULFONYL)-2H-BENZO[D][1,2,3]DIAZABORININ-1-OL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；15% PEG 400, PH5.0 100MM ACETATE, 5MM NAD, 5MM 1,2-DIHYDRO-1-HYDROXY-2- (4-METHYLSULPHONYL)BENZO[E][1,2,3]DIAZABORINE	分辨率 2.50 Å
1DFH X-RAY STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI ENOYL REDUCTASE WITH BOUND NAD AND THIENO-DIAZABORINE 提交 1997-01-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–261（261 aa）链 B 1–261（261 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 TDB 6-METHYL-2(PROPANE-1-SULFONYL)-2H-THIENO[3,2-D][1,2,3]DIAZABORININ-1-OL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；15% PEG 400, PH5.0 100MM ACETATE, 5MM NAD, 5MM 1,2-DIHYDRO-1-HYDROXY-2-(PROP-1-YLSULPHONYL)(5- METHYLTHIENO)[3,2-E][1,2,3]DIAZABORINE	分辨率 2.20 Å
1DFI X-RAY STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI ENOYL REDUCTASE WITH BOUND NAD 提交 1997-01-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–261（261 aa）链 B 1–261（261 aa）链 C 1–261（261 aa）链 D 1–261（261 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；12% PEG 400, PH 5.0 ACETATE, 10MM NAD	分辨率 2.09 Å
1I2Z E. COLI ENOYL REDUCTASE IN COMPLEX WITH NAD AND BRL-12654 提交 2001-02-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 0–261（262 aa）链 B 0–261（262 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 654 4-(2-THIENYL)-1-(4-METHYLBENZYL)-1H-IMIDAZOLE × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
1I30 E. Coli Enoyl Reductase +NAD+SB385826 提交 2001-02-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 0–261（262 aa）链 B 0–261（262 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 826 1,3,4,9-TETRAHYDRO-2-(HYDROXYBENZOYL)-9-[(4-HYDROXYPHENYL)METHYL]-6-METHOXY-2H-PYRIDO[3,4-B]INDOLE × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å R-free 0.277
1LX6 Crystal Structure of E. Coli Enoyl Reductase-NAD+ with a Bound Benzamide Inhibitor 提交 2002-06-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 0–261（262 aa）链 B 0–261（262 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 ZAM 3-[(ACETYL-METHYL-AMINO)-METHYL]-4-AMINO-N-METHYL-N-(1-METHYL-1H-INDOL-2-YLMETHYL)-BENZAMIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M HEPES, 2M(NH4)2SO4,5% PEG400, pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.250
1LXC Crystal Structure of E. Coli Enoyl Reductase-NAD+ with a Bound Acrylamide Inhibitor 提交 2002-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 0–261（262 aa）链 B 0–261（262 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 AYM 3-(6-AMINOPYRIDIN-3-YL)-N-METHYL-N-[(1-METHYL-1H-INDOL-2-YL)METHYL]ACRYLAMIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES, 2M(NH4)2SO4,5% PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.253
1MFP E. coli Enoyl Reductase in complex with NAD and SB611113 提交 2002-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 0–261（262 aa）链 B 0–261（262 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 IDN (E)-N-METHYL-N-(1-METHYL-1H-INDOL-3-YLMETHYL)-3-(7-OXO-5,6,7,8-TETRAHYDRO-[1,8]NAPHTHYRIDIN-3-YL)-ACRYLAMIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；NAD+, HEPES, ammonium sulfate, PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.0K	分辨率 2.33 Å R-free 0.259
1QG6 CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI ENOYL ACYL CARRIER PROTEIN REDUCTASE IN COMPLEX WITH NAD AND TRICLOSAN 提交 1999-04-20	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–261（261 aa）链 B 1–261（261 aa）链 C 1–261（261 aa）链 D 1–261（261 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 TCL TRICLOSAN × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；HANGING DROPS WERE FORMED BY MIXING 4MICROLITRES OF COMPLEX SOLUTION (15MG/ML PROTEIN, 3MM NADH, 0.6MM TRICLOSAN) WITH 4 MICROLITRES OF A RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 12-16% (W/V) PEG 400 AND 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.8-5.2 AT ROOM TEMPERATURE, pH 5.0	分辨率 1.90 Å R-free 0.207
1QSG CRYSTAL STRUCTURE OF ENOYL REDUCTASE INHIBITION BY TRICLOSAN 提交 1999-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–262（262 aa）链 B 1–262（262 aa）链 C 1–262（262 aa）链 D 1–262（262 aa）	未记录	GLC alpha-D-glucopyranose × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 TCL TRICLOSAN × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295.15 K；PEG 4000, AMMONIUM ACETATE, SODIUM ACETATE, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K	分辨率 1.75 Å R-free 0.215
1QSG CRYSTAL STRUCTURE OF ENOYL REDUCTASE INHIBITION BY TRICLOSAN 提交 1999-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–262（262 aa）链 F 1–262（262 aa）链 G 1–262（262 aa）链 H 1–262（262 aa）	未记录	GLC alpha-D-glucopyranose × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 TCL TRICLOSAN × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295.15 K；PEG 4000, AMMONIUM ACETATE, SODIUM ACETATE, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K	分辨率 1.75 Å R-free 0.215

共 11 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FABI_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–261； UniProt 2–262 作者链 B； PDB构建体 1–261； UniProt 2–262

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1d8a
沉积日期 deposition_date	1999-10-21
结构标题 title	E. COLI ENOYL REDUCTASE/NAD+/TRICLOSAN COMPLEX
关键词 keywords	E. COLI ENOYL REDUCTASE, TRICLOSAN, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	24.57 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	23.72 Å
零角强度 I(0) i0	54895200.00
分子量 molecular_weight	56127.0 kDa
排除体积 excluded_volume	69619 Å³
包络体积 envelope_volume	80216 Å³
水化壳体积 shell_volume	27966 Å³
包络直径 envelope_diameter	78.3 Å
壳层 Rg shell_rg	31.09 Å
包络 Rg envelope_rg	23.89 Å
形状 Rg shape_rg	23.73 Å
总 Rg total_rg	24.50 Å
总原子数 total_atoms	3926
残基数 n_residues	514
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	78.5 Å
Rg (实空间) rg_real	24.54 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.45 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.4900e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.6140e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	54900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8913
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.342
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.353
角度范围 angular_range	— – 0.3250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	13860000.0000
实空间数据点数 n_real_points	64
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.893; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.908

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ENOYL-[ACYL-CARRIER-PROTEIN] REDUCTASE
分子量 formula_weight	27761.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.3.1.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	4045

GFLSGKRILVTGVASKLSIAYGIAQAMHREGAELAFTYQNDKLKGRVEEFAAQLGSDIVLQCDVAEDASIDTMFAELGKVWPKFDGFVHSIGFAPGDQLDGDYVNAVTREGFKIAHDISSYSFVAMAKACRSMLNPGSALLTLSYLGAERAIPNYNVMGLAKASLEANVRYMANAMGPEGVRVNAISAGPIRTLAASGIKDFRKMLAHCEAVTPIRRTVTIEDVGNSAAFLCSDLSAGISGEVVHVDGGFSIAAMNELELK

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	663.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	TRICLOSAN
分子量 formula_weight	289.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	119

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1d8aa_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases

结构域编号 domain_id	d1d8ab_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1d8aA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	1d8aB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	80.600 Å
晶胞边长 b length_b	80.600 Å
晶胞边长 c length_c	327.600 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	0.2940

fit	/app/data/saxs_computation/d8/1d8a/1d8a.fit
pddf	/app/data/pr_computation/d8/1d8a/1d8a.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/d8/1d8a/1d8a.dat

E. COLI ENOYL REDUCTASE/NAD+/TRICLOSAN COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ENOYL-[ACYL-CARRIER-PROTEIN] REDUCTASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction