1dbg
CRYSTAL STRUCTURE OF CHONDROITINASE B
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。
七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。
当前条目的 assembly 组成
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 | 单体 | 1 / 0 / 0 / 1 | 与蛋白数一致 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1dbg |
| 沉积日期 deposition_date | 1999-11-02 |
| 结构标题 title | CRYSTAL STRUCTURE OF CHONDROITINASE B |
| 关键词 keywords | BETA HELIX, POLYSACCHARIDE LYASE, DEMATAN SULFATE, LYASE; LYASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1dbg__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1dbg__assembly_1__model_1 | I(q)
1dbg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 23.42 Å |
| Rg（电子密度） | 22.72 Å |
| 总 Rg | 23.66 Å |
| 原子数 | 3856 |
| 残基数 | 481 |
| 排除体积 | 68454 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains
SCOP 2.08 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1dbga_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.80 — Single-stranded right-handed beta-helix |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.80.1 — Pectin lyase-like |
| 家族 Family family | b.80.1.4 — Chondroitinase B |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1dbgA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 160 — 3 Solenoid |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Pectate Lyase C-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Single-stranded right-handed beta-helix, Pectin lyase-like |