M-CALPAIN
Rattus norvegicus
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | CALPAIN × 1 （Q64537） water × 2 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CAN2_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–700； UniProt 1–700 |
1df0
Crystal structure of M-Calpain
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
CALPAIN
Rattus norvegicus
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | M-CALPAIN × 1 （Q07009） water × 2 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CANS_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–184； UniProt 1–184 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1df0 |
| 沉积日期 deposition_date | 1999-11-16 |
| 结构标题 title | Crystal structure of M-Calpain |
| 关键词 keywords | CYSTEINE PROTEASE, CALMODULIN, PAPAIN, CATALYTIC TRIAD, ZYMOGEN ACTIVATION, C2 DOMAIN, PROTEASE, ZYMOGEN, CALPAIN, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1df0__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1df0__assembly_1__model_1 | I(q)
1df0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 31.46 Å |
| Rg（电子密度） | 30.78 Å |
| 总 Rg | 31.34 Å |
| 原子数 | 6391 |
| 残基数 | 800 |
| 排除体积 | 113370 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains
SCOP 2.08 (4 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1df0a1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.39 — EF Hand-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.39.1 — EF-hand |
| 家族 Family family | a.39.1.8 — Penta-EF-hand proteins |
| 结构域编号 domain_id | d1df0a2 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.14 — Calpain large subunit, middle domain (domain III) |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.14.1 — Calpain large subunit, middle domain (domain III) |
| 家族 Family family | b.14.1.1 — Calpain large subunit, middle domain (domain III) |
| 结构域编号 domain_id | d1df0a3 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.3 — Cysteine proteinases |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.3.1 — Cysteine proteinases |
| 家族 Family family | d.3.1.3 — Calpain large subunit, catalytic domain (domain II) |
| 结构域编号 domain_id | d1df0b_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.39 — EF Hand-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.39.1 — EF-hand |
| 家族 Family family | a.39.1.8 — Penta-EF-hand proteins |
CATH v4.4 (4 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1df0A02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin B; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cysteine proteinases |
| 结构域编号 domain_id | 1df0A03 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 380 — |
| 结构域编号 domain_id | 1df0A04 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 238 — Recoverin; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — EF-hand |
| 结构域编号 domain_id | 1df0B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 238 — Recoverin; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — EF-hand |