SAXSdb — 1dfe

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

L36 RIBOSOMAL PROTEIN

Thermus thermophilus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–37	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1DFE	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DGZ RIBOSMAL PROTEIN L36 FROM THERMUS THERMOPHILUS: NMR STRUCTURE ENSEMBLE 提交 1999-11-27	当前字段一致	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–37（37 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
4L47 Crystal Structure of Frameshift Suppressor tRNA SufA6 Bound to Codon CCC-U on the Ribosome 提交 2013-06-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 R9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.22 Å R-free 0.260
4L47 Crystal Structure of Frameshift Suppressor tRNA SufA6 Bound to Codon CCC-U on the Ribosome 提交 2013-06-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 Y9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 354 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.22 Å R-free 0.260
4LEL Crystal Structure of Frameshift Suppressor tRNA SufA6 Bound to Codon CCG-G on the Ribosome 提交 2013-06-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 R9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 321 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.90 Å R-free 0.298
4LEL Crystal Structure of Frameshift Suppressor tRNA SufA6 Bound to Codon CCG-G on the Ribosome 提交 2013-06-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 Y9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 349 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.90 Å R-free 0.298
4LFZ Crystal Structure of Frameshift Suppressor tRNA SufA6 Bound to Codon CCC-U in the Absence of Paromomycin 提交 2013-06-27	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 R9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 320 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl2, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.92 Å R-free 0.265
4LFZ Crystal Structure of Frameshift Suppressor tRNA SufA6 Bound to Codon CCC-U in the Absence of Paromomycin 提交 2013-06-27	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 Y9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 354 ZN ZINC ION × 3 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl2, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.92 Å R-free 0.265
4LNT Crystal Structure of tRNA Proline (CGG) Bound to Codon CCC-U on the Ribosome 提交 2013-07-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 R9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 325 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl2, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.94 Å R-free 0.265
4LNT Crystal Structure of tRNA Proline (CGG) Bound to Codon CCC-U on the Ribosome 提交 2013-07-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 Y9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 352 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl2, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.94 Å R-free 0.265
4LSK Crystal Structure of tRNA Proline (CGG) Bound to Codon CCG-G on the Ribosome 提交 2013-07-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 R9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 321 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.48 Å R-free 0.270
4LSK Crystal Structure of tRNA Proline (CGG) Bound to Codon CCG-G on the Ribosome 提交 2013-07-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 Y9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 351 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.48 Å R-free 0.270
4LT8 Crystal Structure of tRNA Proline (CGG) Bound to Codon CCC-G on the Ribosome 提交 2013-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 R9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 324 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl2, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.14 Å R-free 0.262
4LT8 Crystal Structure of tRNA Proline (CGG) Bound to Codon CCC-G on the Ribosome 提交 2013-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 Y9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 352 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；4% PEG 20k, 4% PEG550 MME, 0.1M TRIS-ACETATE, 0.2M KSCN, 10mM MgCl2, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.14 Å R-free 0.262
4V4X Crystal structure of the 70S Thermus thermophilus ribosome showing how the 16S 3'-end mimicks mRNA E and P codons. 提交 2006-06-27	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric	链 B8 1–37（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 5.00 Å R-free 0.323
4V4Y Crystal structure of the 70S Thermus thermophilus ribosome with translocated and rotated Shine-Dalgarno Duplex. 提交 2006-06-27	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：57-meric	链 B8 1–37（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 5.50 Å R-free 0.326
4V4Z 70S Thermus thermophilous ribosome functional complex with mRNA and E- and P-site tRNAs at 4.5A. 提交 2006-06-27	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric	链 B8 1–37（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 4.51 Å R-free 0.345
6C5L Conformation of methylated GGQ in the Peptidyl Transferase Center during translation termination (T. thermophilus) 提交 2018-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：59-meric	链 B9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；5 mM HEPES, pH 7.5, 10 mM magnesium acetate, 50 mM potassium chloride, 10 mM ammonium chloride, 6 mM BME	分辨率 3.20 Å R-free 0.247
6C5L Conformation of methylated GGQ in the Peptidyl Transferase Center during translation termination (T. thermophilus) 提交 2018-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：59-meric	链 D9 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 256 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；5 mM HEPES, pH 7.5, 10 mM magnesium acetate, 50 mM potassium chloride, 10 mM ammonium chloride, 6 mM BME	分辨率 3.20 Å R-free 0.247
6CFJ Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with histidyl-CAM and bound to mRNA and A-, P-, and E-site tRNAs at 2.8A resolution 提交 2018-02-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 19 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1492 K POTASSIUM ION × 2 EZG N-[(1R,2R)-1,3-dihydroxy-1-(4-nitrophenyl)propan-2-yl]-L-histidinamide × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；292 K；0.1-0.2 M Arginine-HCl, 0.1M Tris-HCl pH 7.6, 2.5% PEG-20K, 7-12% MPD, 0.5 mM BME	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
6CFJ Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with histidyl-CAM and bound to mRNA and A-, P-, and E-site tRNAs at 2.8A resolution 提交 2018-02-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric	链 29 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1113 K POTASSIUM ION × 2 EZG N-[(1R,2R)-1,3-dihydroxy-1-(4-nitrophenyl)propan-2-yl]-L-histidinamide × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；292 K；0.1-0.2 M Arginine-HCl, 0.1M Tris-HCl pH 7.6, 2.5% PEG-20K, 7-12% MPD, 0.5 mM BME	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
6CFK Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with D-histidyl-CAM and bound to protein Y (YfiA) at 2.7A resolution 提交 2018-02-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric	链 19 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1422 K POTASSIUM ION × 1 EZP N-[(1R,2R)-1,3-dihydroxy-1-(4-nitrophenyl)propan-2-yl]-D-histidinamide × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 ARG ARGININE × 2 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；292 K；0.1-0.2 M Arginine-HCl, 0.1M Tris-HCl pH 7.6, 2.5% PEG-20K, 7-12% MPD, 0.5 mM BME	分辨率 2.70 Å R-free 0.253
6CFK Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with D-histidyl-CAM and bound to protein Y (YfiA) at 2.7A resolution 提交 2018-02-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric	链 29 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 940 K POTASSIUM ION × 1 EZP N-[(1R,2R)-1,3-dihydroxy-1-(4-nitrophenyl)propan-2-yl]-D-histidinamide × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；292 K；0.1-0.2 M Arginine-HCl, 0.1M Tris-HCl pH 7.6, 2.5% PEG-20K, 7-12% MPD, 0.5 mM BME	分辨率 2.70 Å R-free 0.253
6CFL Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with lysyl-CAM and bound to protein Y (YfiA) at 2.6A resolution 提交 2018-02-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric	链 19 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1474 K POTASSIUM ION × 1 EZM N-[(1R,2R)-1,3-dihydroxy-1-(4-nitrophenyl)propan-2-yl]-L-lysinamide × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 ARG ARGININE × 2 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；292 K；0.1-0.2 M Arginine-HCl, 0.1M Tris-HCl pH 7.6, 2.5% PEG-20K, 7-12% MPD, 0.5 mM BME	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
6CFL Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with lysyl-CAM and bound to protein Y (YfiA) at 2.6A resolution 提交 2018-02-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric	链 29 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 955 K POTASSIUM ION × 1 EZM N-[(1R,2R)-1,3-dihydroxy-1-(4-nitrophenyl)propan-2-yl]-L-lysinamide × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；292 K；0.1-0.2 M Arginine-HCl, 0.1M Tris-HCl pH 7.6, 2.5% PEG-20K, 7-12% MPD, 0.5 mM BME	分辨率 2.60 Å R-free 0.252

共 14 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL36_THETH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–37； UniProt 1–37

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1dfe
沉积日期 deposition_date	1999-11-19
结构标题 title	NMR STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEIN L36 FROM THERMUS THERMOPHILUS
关键词 keywords	ANTI-PARALLEL BETA SHEET, ZINC BINDING, ribosome; RIBOSOME
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	11.76 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	10.41 Å
零角强度 I(0) i0	592373.00
分子量 molecular_weight	4497.0 kDa
排除体积 excluded_volume	5540 Å³
包络体积 envelope_volume	6519 Å³
水化壳体积 shell_volume	5886 Å³
包络直径 envelope_diameter	36.1 Å
壳层 Rg shell_rg	14.89 Å
包络 Rg envelope_rg	10.90 Å
形状 Rg shape_rg	10.35 Å
总 Rg total_rg	11.90 Å
总原子数 total_atoms	643
残基数 n_residues	37
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	39.4 Å
Rg (实空间) rg_real	11.77 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.9240e+05
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.0210e+03
Rg (倒空间) rg_reciprocal	11.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	592400.0000
解质量估计 total_estimate	0.8908
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	12.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.273
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.487
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	74450.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.901; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.887; Smooth: 0.990

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1dfea_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.42 — Ribosomal protein L36
超家族 Superfamily superfamily	g.42.1 — Ribosomal protein L36
家族 Family family	g.42.1.1 — Ribosomal protein L36

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	L36 RIBOSOMAL PROTEIN
分子量 formula_weight	4435.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	643

来源生物 organism	Thermus thermophilus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

NMR STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEIN L36 FROM THERMUS THERMOPHILUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

L36 RIBOSOMAL PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

fit	/app/data/saxs_computation/df/1dfe/1dfe.fit
pddf	/app/data/pr_computation/df/1dfe/1dfe.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/df/1dfe/1dfe.dat