Bacillus subtilis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*AP*TP*CP*GP*CP*CP*TP*AP*AP*TP*AP*GP*GP*CP*GP*AP*T)-3') ; × 2 CALCIUM ION × 8 BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 water × 4 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | T2B1_BACSU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–299； UniProt 1–299 |
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| 条目编号 entry_id | 1dmu |
| 沉积日期 deposition_date | 1999-12-15 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the restriction endonuclease BglI (e.c.3.1.21.4) bound to its dna recognition sequence |
| 关键词 keywords | PROTEIN-DNA COMPLEX, ACTIVE SITE CALCIUM IONS, ALPHA/BETA STRUCTURE, A:A MISMATCH, HYDROLASE-DNA COMPLEX; HYDROLASE/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 25.41 Å |
| Rg（电子密度） | 24.37 Å |
| 总 Rg | 25.16 Å |
| 原子数 | 5428 |
| 残基数 | 632 |
| 排除体积 | 94982 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1dmua_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.52 — Restriction endonuclease-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.52.1 — Restriction endonuclease-like |
| 家族 Family family | c.52.1.4 — Restriction endonuclease BglI |
| 结构域编号 domain_id | 1dmuA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 600 — ECO RV Endonuclease; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Restriction endonuclease BglI |