1e5l

Apo saccharopine reductase from Magnaporthe grisea

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 2 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1e5l
沉积日期 deposition_date2000-07-27
结构标题 titleApo saccharopine reductase from Magnaporthe grisea
关键词 keywordsOXIDOREDUCTASE, SACCHAROPINE REDUCTASE, LYSINE BIOSYNTHESIS, ALPHA- AMINOADIPATE PATHWAY; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1e5l__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1e5l__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1e5l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)31.87 Å
Rg(电子密度)30.86 Å
总 Rg31.62 Å
原子数6884
残基数898
排除体积123620 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1e5l__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1e5la1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_idd1e5la2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family familyd.81.1.2 — Homoserine dehydrogenase-like
结构域编号 domain_idd1e5lb1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_idd1e5lb2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family familyd.81.1.2 — Homoserine dehydrogenase-like

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1e5lA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1e5lA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
结构域编号 domain_id1e5lA03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1870 — Domain 3, Saccharopine reductase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Domain 3, Saccharopine reductase
结构域编号 domain_id1e5lB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1e5lB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
结构域编号 domain_id1e5lB03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1870 — Domain 3, Saccharopine reductase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Domain 3, Saccharopine reductase

7. 引用文献 (2)