YM1 SECRETORY PROTEIN
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 2-amino-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | O35744 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 22–399 |
1e9l
The crystal structure of novel mammalian lectin Ym1 suggests a saccharide binding site
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1e9l |
| 沉积日期 deposition_date | 2000-10-21 |
| 结构标题 title | The crystal structure of novel mammalian lectin Ym1 suggests a saccharide binding site |
| 关键词 keywords | MACROPHAGE SECRETORY PROTEIN, INFLAMMATION, LECTIN, INDUCIBLE, SECRETORY; MACROPHAGE SECRETORY PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1e9l__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1e9l__assembly_1__model_1 | I(q)
1e9l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 21.36 Å |
| Rg（电子密度） | 20.20 Å |
| 总 Rg | 21.14 Å |
| 原子数 | 3583 |
| 残基数 | 372 |
| 排除体积 | 52452 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1e9la1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.8 — (Trans)glycosidases |
| 家族 Family family | c.1.8.5 — Type II chitinase |
| 结构域编号 domain_id | d1e9la2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.26 — FKBP-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.26.3 — Chitinase insertion domain |
| 家族 Family family | d.26.3.1 — Chitinase insertion domain |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1e9lA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 80 — Glycosidases |
| 结构域编号 domain_id | 1e9lA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Chitinase A; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |