1ecm

ATOMIC STRUCTURE OF THE BURIED CATALYTIC POCKET OF ESCHERICHIA COLI CHORISMATE MUTASE

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ENDO-OXABICYCLIC TRANSITION STATE ANALOGUE

Escherichia coli

UniProt P07022

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 4 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PHEA_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–109; UniProt 1–109 作者链 B; PDB构建体 1–109; UniProt 1–109

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ecm
沉积日期 deposition_date1994-11-28
结构标题 titleATOMIC STRUCTURE OF THE BURIED CATALYTIC POCKET OF ESCHERICHIA COLI CHORISMATE MUTASE
关键词 keywordsP-PROTEIN, CHORISMATE MUTASE DOMAIN, CHORISMATE MUTASE; CHORISMATE MUTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ecm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ecm__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ecm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)34.43 Å
Rg(电子密度)35.04 Å
总 Rg35.03 Å
原子数3130
残基数372
排除体积55713 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ecm__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1ecm__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1ecma_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.130 — Chorismate mutase II
超家族 Superfamily superfamilya.130.1 — Chorismate mutase II
家族 Family familya.130.1.1 — Dimeric chorismate mutase
结构域编号 domain_idd1ecmb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.130 — Chorismate mutase II
超家族 Superfamily superfamilya.130.1 — Chorismate mutase II
家族 Family familya.130.1.1 — Dimeric chorismate mutase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1ecmA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology59 — Chorismate Mutase Domain, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Chorismate mutase
结构域编号 domain_id1ecmB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology59 — Chorismate Mutase Domain, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Chorismate mutase

7. 引用文献 (1)