1ega

CRYSTAL STRUCTURE OF A WIDELY CONSERVED GTPASE ERA

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (GTP-BINDING PROTEIN ERA)

物种未注明

UniProt P06616

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 SULFATE ION × 5 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ERA_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–301; UniProt 1–301 作者链 B; PDB构建体 1–301; UniProt 1–301

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ega
沉积日期 deposition_date1998-12-01
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF A WIDELY CONSERVED GTPASE ERA
关键词 keywordsERA, GTPASE, RNA-BINDING, RAS-LIKE, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ega__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ega__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ega__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)30.82 Å
Rg(电子密度)30.41 Å
总 Rg30.94 Å
原子数4641
残基数585
排除体积82991 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ega__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1egaa1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.8 — G proteins
结构域编号 domain_idd1egaa2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.52 — Alpha-lytic protease prodomain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.52.3 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)
家族 Family familyd.52.3.1 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)
结构域编号 domain_idd1egab1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.8 — G proteins
结构域编号 domain_idd1egab2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.52 — Alpha-lytic protease prodomain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.52.3 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)
家族 Family familyd.52.3.1 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1egaA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id1egaA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — K homology (KH) domain
结构域编号 domain_id1egaB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id1egaB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — K homology (KH) domain

7. 引用文献 (2)