EPS15
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 121–218 | 片段：EPS15 HOMOLOGY (EH) DOMAIN 2, RESIDUES 121-218 | CA CALCIUM ION × 1 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120 MILLIMOLAR；压力 ATMOSPHERIC NMR样品组成：H2O AND D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1EH2 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1C07 STRUCTURE OF THE THIRD EPS15 HOMOLOGY DOMAIN OF HUMAN EPS15 提交 1999-07-14 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
217–311（95 aa）
片段：EPS15 HOMOLOGY (EH) DOMAIN 3
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM KCL, 2mM CACL2, 2mM NAN3；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.5-1MM EH3; 20MM D-TRIS, 100MM KCL, 2MM CACL2, 2MM NAN3, 0.1MM D-DTT; 95% H2O,
5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1F8H STRUCTURE OF THE SECOND EPS15 HOMOLOGY DOMAIN OF HUMAN EPS15 IN COMPLEX WITH PTGSSSTNPFR 提交 2000-06-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
121–215（95 aa）
片段：RESIDUES 121-218 OF HUMAN EPS15
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM {15N}-EH2 and 5 mM peptide,
20 mM perdeuterated Tris, 100 mM potassium chloride,
1 mM perdeuterated DTT, 1 mM sodium azide
2 mM calcium chloride | 10%/90% D2O/H2O
NMR样品组成
1 mM {15N}-EH2 and 5 mM peptide,
20 mM perdeuterated Tris, 100 mM potassium chloride,
1 mM perdeuterated DTT, 1 mM sodium azide
2 mM calcium chloride | 99.999% D2O
NMR样品组成
0.2 mM {15N}-EH2 and 5 mM peptide,
20 mM perdeuterated Tris, 100 mM potassium chloride,
1 mM perdeuterated DTT, 1 mM sodium azide
2 mM calcium chloride | 10%/90% D2O/H2O
NMR样品组成
0.2 mM {15N}-EH2 and 5 mM peptide,
20 mM perdeuterated Tris, 100 mM potassium chloride,
1 mM perdeuterated DTT, 1 mM sodium azide
2 mM calcium chloride | 10%/90% D2O/H2O
|
分辨率未提供 |
| 1FF1 STRUCTURE OF THE SECOND EPS15 HOMOLOGY DOMAIN OF HUMAN EPS15 IN COMPLEX WITH PTGSSSTNPFL 提交 2000-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
121–215（95 aa）
片段：SECOND EH DOMAIN
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1 MM {15N}-EH2 AND 5 MM PEPTIDE, 20 MM PERDEUTERATED TRIS, 100 MM POTASSIUM CHLORIDE, 1 MM PERDEUTERATED DTT, 1 MM SODIUM AZIDE, 2 MM CALCIUM CHLORIDE | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 MM {15N}-EH2 AND 5 MM PEPTIDE, 20 MM PERDEUTERATED TRIS, 100 MM POTASSIUM CHLORIDE, 1 MM PERDEUTERATED DTT, 1 MM SODIUM AZIDE, 2 MM CALCIUM CHLORIDE | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2JXC Structure of the EPS15-EH2 Stonin2 Complex 提交 2007-11-12 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
121–215（95 aa）
片段：EH 2 domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] EH2, 0.5-1 mM Stonin peptide, 2 mM CA, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.5-1 mM EH2, 0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Stonin peptide, 2 mM CA, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] EH2, 0.5-1 mM Stonin peptide, 2 mM CA, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5-1 mM EH2, 0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Stonin peptide, 2 mM CA, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.6 mM EH2, 0.6 mM Stonin peptide, 2 mM CA, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4RH5 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
846–854（9 aa）
片段：PTYR849 peptide (UNP RESIDUES 846-854)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 4RH9 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) H812F, M883G mutant in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
846–854（9 aa）
片段：pTyr849 peptide (UNP RESIDUES 846-854)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.226 |
| 4RHG Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) D811E, C842S mutant in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
846–854（9 aa）
片段：pTyr849 peptide (UNP RESIDUES 846-854)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.209 |
| 4S0G Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) in complex with Eps15 pTyr849 P850V peptide 提交 2014-12-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
846–854（9 aa）
片段：Phosphotyrosine 849 peptide, UNP residues 846-854
|
突变：P850V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl, 26% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.229 |
| 5JP2 Fcho1 Mu homology domain (Danio Rerio) with bound Eps15 peptide 提交 2016-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
615–637（23 aa）
片段：UNP Residues 615-637
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；100 mM Bis-Tris propane pH, 6.0, 200 mM sodium citrate, 22% PEG 3350 and 10 mM DTT
Crystals were cryopretetcted in 22% glycerol before flash cooling
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.234 |
| 5JP2 Fcho1 Mu homology domain (Danio Rerio) with bound Eps15 peptide 提交 2016-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
615–637（23 aa）
片段：UNP Residues 615-637
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；100 mM Bis-Tris propane pH, 6.0, 200 mM sodium citrate, 22% PEG 3350 and 10 mM DTT
Crystals were cryopretetcted in 22% glycerol before flash cooling
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.234 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | EP15_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–103； UniProt 121–218 |
