1ekz

NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE THIRD DSRBD FROM DROSOPHILA STAUFEN AND A RNA HAIRPIN

Method: SOLUTION NMR

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MATERNAL EFFECT PROTEIN (STAUFEN)

Drosophila melanogaster

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	单体	蛋白 1 RNA 1	STAUFEN DOUBLE-STRANDED RNA BINDING DOMAIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	STAU_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–76； UniProt 571–646

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ekz
沉积日期 deposition_date	2000-03-11
结构标题 title	NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE THIRD DSRBD FROM DROSOPHILA STAUFEN AND A RNA HAIRPIN
关键词 keywords	protein/RNA, protein dsRBD, Drosophila, RNA hairpin, cell cycle-RNA COMPLEX; cell cycle/RNA
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ekz__assembly_1__model_31

Assembly 1 · Model 31 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ekz__assembly_1__model_31 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ekz__assembly_1__model_31 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.40 Å
Rg（电子密度）	17.87 Å
总 Rg	18.67 Å
原子数	2173
残基数	106
排除体积	19635 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ekz__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`1ekz__assembly_1__model_2`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`1ekz__assembly_1__model_3`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`1ekz__assembly_1__model_4`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`1ekz__assembly_1__model_5`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`1ekz__assembly_1__model_6`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`1ekz__assembly_1__model_7`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`1ekz__assembly_1__model_8`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`1ekz__assembly_1__model_9`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`1ekz__assembly_1__model_10`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	11	`1ekz__assembly_1__model_11`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	12	`1ekz__assembly_1__model_12`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	13	`1ekz__assembly_1__model_13`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	14	`1ekz__assembly_1__model_14`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	15	`1ekz__assembly_1__model_15`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	16	`1ekz__assembly_1__model_16`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	17	`1ekz__assembly_1__model_17`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	18	`1ekz__assembly_1__model_18`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	19	`1ekz__assembly_1__model_19`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	20	`1ekz__assembly_1__model_20`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	21	`1ekz__assembly_1__model_21`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	22	`1ekz__assembly_1__model_22`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	23	`1ekz__assembly_1__model_23`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	24	`1ekz__assembly_1__model_24`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	25	`1ekz__assembly_1__model_25`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	26	`1ekz__assembly_1__model_26`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	27	`1ekz__assembly_1__model_27`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	28	`1ekz__assembly_1__model_28`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	29	`1ekz__assembly_1__model_29`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	30	`1ekz__assembly_1__model_30`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	31	`1ekz__assembly_1__model_31`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	32	`1ekz__assembly_1__model_32`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	33	`1ekz__assembly_1__model_33`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	34	`1ekz__assembly_1__model_34`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	35	`1ekz__assembly_1__model_35`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	36	`1ekz__assembly_1__model_36`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1ekza_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamily	d.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family family	d.50.1.1 — Double-stranded RNA-binding domain (dsRBD)

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1ekzA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	STAUFEN DOUBLE-STRANDED RNA BINDING DOMAIN
分子量 formula_weight	9612.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	78228

描述 description	MATERNAL EFFECT PROTEIN (STAUFEN)
分子量 formula_weight	8464.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE THIRD DSRBD FROM DROSOPHILA STAUFEN AND A RNA HAIRPIN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MATERNAL EFFECT PROTEIN (STAUFEN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ekz__assembly_1__model_31

1ekz__assembly_1__model_31 | I(q)

1ekz__assembly_1__model_31 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE THIRD DSRBD FROM DROSOPHILA STAUFEN AND A RNA HAIRPIN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MATERNAL EFFECT PROTEIN (STAUFEN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ekz__assembly_1__model_31

1ekz__assembly_1__model_31 | I(q)

1ekz__assembly_1__model_31 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)