SAXSdb — 1epp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ENDOTHIAPEPSIN

Cryphonectria parasitica

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	SULFATE ION × 2 ;N-(dimethylsulfamoyl)-L-phenylalanyl-N-[(1S,2S)-2-hydroxy-4-{[(2S)-2-methylbutyl]amino}-1-(2-methylpropyl)-4-oxobutyl]-N~6~-(methylcarbamothioyl)-L-lysinamide ; × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CARP_CRYPA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–330； UniProt 90–419

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1epp
沉积日期 deposition_date	1994-07-27
结构标题 title	ENDOTHIA ASPARTIC PROTEINASE (ENDOTHIAPEPSIN) COMPLEXED WITH PD-130,693 (MAS PHE LYS+MTF STA MBA)
关键词 keywords	HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX, ACID PROTEINASE; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1epp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1epp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1epp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.66 Å
Rg（电子密度）	19.52 Å
总 Rg	20.57 Å
原子数	2446
残基数	330
排除体积	43320 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1epp__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ENDOTHIAPEPSIN
分子量 formula_weight	33813.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.23.22
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E
原子数 atom_count	2706

STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK

来源 Source

来源生物 organism	Cryphonectria parasitica
通用名 common_name	chestnut blight fungus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5116

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	;N-(dimethylsulfamoyl)-L-phenylalanyl-N-[(1S,2S)-2-hydroxy-4-{[(2S)-2-methylbutyl]amino}-1-(2-methylpropyl)-4-oxobutyl]-N~6~-(methylcarbamothioyl)-L-lysinamide ;
分子量 formula_weight	700.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	260

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1eppe_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.50 — Acid proteases
超家族 Superfamily superfamily	b.50.1 — Acid proteases
家族 Family family	b.50.1.2 — Pepsin-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1eppE01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acid Proteases

结构域编号 domain_id	1eppE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Acid Proteases

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晶胞边长 a length_a	43.100 Å
晶胞边长 b length_b	75.600 Å
晶胞边长 c length_c	42.900 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.20 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.1600
R_work r_work	—
R_free r_free	—

ENDOTHIA ASPARTIC PROTEINASE (ENDOTHIAPEPSIN) COMPLEXED WITH PD-130,693 (MAS PHE LYS+MTF STA MBA)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ENDOTHIAPEPSIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1epp__assembly_1__model_1

1epp__assembly_1__model_1 | I(q)

1epp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (3)

ENDOTHIA ASPARTIC PROTEINASE (ENDOTHIAPEPSIN) COMPLEXED WITH PD-130,693 (MAS PHE LYS+MTF STA MBA)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ENDOTHIAPEPSIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1epp__assembly_1__model_1

1epp__assembly_1__model_1 | I(q)

1epp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (3)