1f16

SOLUTION STRUCTURE OF A PRO-APOPTOTIC PROTEIN BAX

Method: SOLUTION NMR Dmax: 50.6 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (APOPTOSIS REGULATOR BAX, MEMBRANE ISOFORM ALPHA)

Homo sapiens

UniProt Q07812

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–192 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 6;305 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM;压力 AMBIENT NMR样品组成:1MM BAX U-15N,13C; 10mM TRIS-ACETATE PH 6.0 2MM DTT 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 35 个其他 PDB 条目、61 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAXA_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–192; UniProt 1–192

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1f16

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1f16
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1f16
沉积日期 deposition_date2000-05-18
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF A PRO-APOPTOTIC PROTEIN BAX
关键词 keywordsHELICAL PROTEIN, APOPTOSIS; APOPTOSIS
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.77
回转半径 Rg (电子) rg_electron17.92
零角强度 I(0) i02400460000.00
分子量 molecular_weight423630.0 kDa
排除体积 excluded_volume532910 ų
包络体积 envelope_volume70463 ų
水化壳体积 shell_volume25698 ų
包络直径 envelope_diameter83.6
壳层 Rg shell_rg30.14
包络 Rg envelope_rg24.97
形状 Rg shape_rg17.85
总 Rg total_rg18.36
总原子数 total_atoms59540
残基数 n_residues3840
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax50.6
Rg (实空间) rg_real17.58
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.06
I(0) (实空间) i0_real2.2870e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.0120e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.83
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2400000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6751
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary22.9
偏度 Skewness skewness0.185
峰度 Kurtosis kurtosis-0.212
角度范围 angular_range— – 0.4250 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.9330
最高正则化参数 α highest_alpha1523000.0000
实空间数据点数 n_real_points74
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.002; Oscil: 0.945; Stabil: 0.992; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.972; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1f16a_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family familyf.1.4.1 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1f16A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Blc2-like

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)