1f3y

SOLUTION STRUCTURE OF THE NUDIX ENZYME DIADENOSINE TETRAPHOSPHATE HYDROLASE FROM LUPINUS ANGUSTIFOLIUS L.

Method: SOLUTION NMR

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;DIADENOSINE 5',5'''-P1,P4-TETRAPHOSPHATE HYDROLASE ;

Lupinus angustifolius

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O04841_LUPAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–165； UniProt 35–199

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1f3y
沉积日期 deposition_date	2000-06-06
结构标题 title	SOLUTION STRUCTURE OF THE NUDIX ENZYME DIADENOSINE TETRAPHOSPHATE HYDROLASE FROM LUPINUS ANGUSTIFOLIUS L.
关键词 keywords	Enzyme, MIXED 4-STRANDED BETA SHEET, 2-STRANDED ANTIPARALLEL SHEET, ALPHA-BETA-ALPHA SANDWICH, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	SOLUTION NMR

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1f3y__assembly_1__model_8

Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1f3y__assembly_1__model_8 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1f3y__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.92 Å
Rg（电子密度）	15.61 Å
总 Rg	16.77 Å
原子数	2617
残基数	165
排除体积	23615 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1f3y__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`1f3y__assembly_1__model_2`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`1f3y__assembly_1__model_3`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`1f3y__assembly_1__model_4`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`1f3y__assembly_1__model_5`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`1f3y__assembly_1__model_6`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`1f3y__assembly_1__model_7`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`1f3y__assembly_1__model_8`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`1f3y__assembly_1__model_9`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`1f3y__assembly_1__model_10`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	11	`1f3y__assembly_1__model_11`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	12	`1f3y__assembly_1__model_12`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	13	`1f3y__assembly_1__model_13`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	14	`1f3y__assembly_1__model_14`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	15	`1f3y__assembly_1__model_15`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	16	`1f3y__assembly_1__model_16`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	17	`1f3y__assembly_1__model_17`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	18	`1f3y__assembly_1__model_18`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	19	`1f3y__assembly_1__model_19`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	20	`1f3y__assembly_1__model_20`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	21	`1f3y__assembly_1__model_21`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	22	`1f3y__assembly_1__model_22`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	23	`1f3y__assembly_1__model_23`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	24	`1f3y__assembly_1__model_24`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	25	`1f3y__assembly_1__model_25`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1f3ya_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.113 — Nudix
超家族 Superfamily superfamily	d.113.1 — Nudix
家族 Family family	d.113.1.1 — MutT-like

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1f3yA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	79 — Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	;DIADENOSINE 5',5'''-P1,P4-TETRAPHOSPHATE HYDROLASE ;
分子量 formula_weight	18834.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.17
突变 mutation	Y1G/C2P/H3L/S4G
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	65425

来源生物 organism	Lupinus angustifolius
通用名 common_name	narrow-leaved blue lupine
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3871
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

SOLUTION STRUCTURE OF THE NUDIX ENZYME DIADENOSINE TETRAPHOSPHATE HYDROLASE FROM LUPINUS ANGUSTIFOLIUS L.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;DIADENOSINE 5',5'''-P1,P4-TETRAPHOSPHATE HYDROLASE ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1f3y__assembly_1__model_8

1f3y__assembly_1__model_8 | I(q)

1f3y__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

SOLUTION STRUCTURE OF THE NUDIX ENZYME DIADENOSINE TETRAPHOSPHATE HYDROLASE FROM LUPINUS ANGUSTIFOLIUS L.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;DIADENOSINE 5',5'''-P1,P4-TETRAPHOSPHATE HYDROLASE ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1f3y__assembly_1__model_8

1f3y__assembly_1__model_8 | I(q)

1f3y__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)