1f80

HOLO-(ACYL CARRIER PROTEIN) SYNTHASE IN COMPLEX WITH HOLO-(ACYL CARRIER PROTEIN)

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HOLO-(ACYL CARRIER PROTEIN) SYNTHASE

Bacillus subtilis

UniProt P96618

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 ACYL CARRIER PROTEIN × 3 (P80643) SODIUM ION × 1 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACPS_BACSU
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–120; UniProt 3–121 作者链 B; PDB构建体 1–120; UniProt 3–121 作者链 C; PDB构建体 1–120; UniProt 3–121

ACYL CARRIER PROTEIN

Bacillus subtilis

UniProt P80643

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 HOLO-(ACYL CARRIER PROTEIN) SYNTHASE × 3 (P96618) SODIUM ION × 1 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACP_BACSU
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 6–81; UniProt 2–77 作者链 E; PDB构建体 6–81; UniProt 2–77 作者链 F; PDB构建体 6–81; UniProt 2–77

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1f80
沉积日期 deposition_date2000-06-28
结构标题 titleHOLO-(ACYL CARRIER PROTEIN) SYNTHASE IN COMPLEX WITH HOLO-(ACYL CARRIER PROTEIN)
关键词 keywords9-strand pseudo beta barrel holo-(acyl carrier protein) acp holo-(acyl carrier protein) synthase acps, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1f80__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1f80__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1f80__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.55 Å
Rg(电子密度)25.48 Å
总 Rg26.30 Å
原子数4419
残基数570
排除体积78339 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1f80__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 13 domains

SCOP 2.08 (7 domains)

结构域编号 domain_idd1f80a_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.150 — 4'-phosphopantetheinyl transferase
超家族 Superfamily superfamilyd.150.1 — 4'-phosphopantetheinyl transferase
家族 Family familyd.150.1.2 — Holo-(acyl carrier protein) synthase ACPS
结构域编号 domain_idd1f80b_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.150 — 4'-phosphopantetheinyl transferase
超家族 Superfamily superfamilyd.150.1 — 4'-phosphopantetheinyl transferase
家族 Family familyd.150.1.2 — Holo-(acyl carrier protein) synthase ACPS
结构域编号 domain_idd1f80c_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.150 — 4'-phosphopantetheinyl transferase
超家族 Superfamily superfamilyd.150.1 — 4'-phosphopantetheinyl transferase
家族 Family familyd.150.1.2 — Holo-(acyl carrier protein) synthase ACPS
结构域编号 domain_idd1f80d1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.28 — Acyl carrier protein-like
超家族 Superfamily superfamilya.28.1 — ACP-like
家族 Family familya.28.1.1 — Acyl-carrier protein (ACP)
结构域编号 domain_idd1f80d2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd1f80e_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.28 — Acyl carrier protein-like
超家族 Superfamily superfamilya.28.1 — ACP-like
家族 Family familya.28.1.1 — Acyl-carrier protein (ACP)
结构域编号 domain_idd1f80f_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.28 — Acyl carrier protein-like
超家族 Superfamily superfamilya.28.1 — ACP-like
家族 Family familya.28.1.1 — Acyl-carrier protein (ACP)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1f80A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology470 — Ribosomal Protein L22; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — 4'-phosphopantetheinyl transferase domain
结构域编号 domain_id1f80B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology470 — Ribosomal Protein L22; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — 4'-phosphopantetheinyl transferase domain
结构域编号 domain_id1f80C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology470 — Ribosomal Protein L22; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — 4'-phosphopantetheinyl transferase domain
结构域编号 domain_id1f80D00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ACP-like
结构域编号 domain_id1f80E00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ACP-like
结构域编号 domain_id1f80F00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ACP-like

7. 引用文献 (1)