1f81

SOLUTION STRUCTURE OF THE TAZ2 DOMAIN OF THE TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR PROTEIN CBP

Method: SOLUTION NMR Dmax: 39.5 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CREB-BINDING PROTEIN

Mus musculus

UniProt P45481

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1764–1850 片段:TAZ2 DOMAIN (1764-1850) ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 5.9;298 K;离子强度(mmCIF原始值)25 mM;压力 1 NMR样品组成:1.5 mM Taz2 | 25 mM deuterated acetate 0.1 mM ZnCl2 0.1 mM DTT pH 5.9 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CBP_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–88; UniProt 1764–1850

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1f81

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1f81
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1f81
沉积日期 deposition_date2000-06-28
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF THE TAZ2 DOMAIN OF THE TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR PROTEIN CBP
关键词 keywordsZINC FINGER, TAZ2, CBP, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier13.49
回转半径 Rg (电子) rg_electron13.27
零角强度 I(0) i0695081000.00
分子量 molecular_weight200900.0 kDa
排除体积 excluded_volume243090 ų
包络体积 envelope_volume21101 ų
水化壳体积 shell_volume12467 ų
包络直径 envelope_diameter46.7
壳层 Rg shell_rg20.08
包络 Rg envelope_rg14.87
形状 Rg shape_rg13.31
总 Rg total_rg13.29
总原子数 total_atoms27500
残基数 n_residues1740
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax39.5
Rg (实空间) rg_real13.41
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.25
I(0) (实空间) i0_real6.9510e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.9610e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal13.42
I(0) (倒空间) i0_reciprocal695100000.0000
解质量估计 total_estimate0.8377
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary20.5
偏度 Skewness skewness-0.059
峰度 Kurtosis kurtosis-0.691
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha66440.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.965; Stabil: 0.997; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1f81a_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.53 — TAZ domain
超家族 Superfamily superfamilyg.53.1 — TAZ domain
家族 Family familyg.53.1.1 — TAZ domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1f81A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1020 — CREB-binding Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TAZ domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)