1fcd

THE STRUCTURE OF FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE FROM A PURPLE PHOTOTROPHIC BACTERIUM CHROMATIUM VINOSUM AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (FLAVIN-BINDING SUBUNIT)

Allochromatium vinosum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (CYTOCHROME SUBUNIT) × 1 （Q06529） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 HEME C × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (CYTOCHROME SUBUNIT) × 1 （Q06529） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 HEME C × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DHSU_CHRVI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–401； UniProt 31–431 作者链 B； PDB构建体 1–401； UniProt 31–431

FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (CYTOCHROME SUBUNIT)

Allochromatium vinosum

UniProt Q06529

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (FLAVIN-BINDING SUBUNIT) × 1 （Q06530） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 HEME C × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (FLAVIN-BINDING SUBUNIT) × 1 （Q06530） FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 HEME C × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CYSD_CHRVI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–174； UniProt 26–199 作者链 D； PDB构建体 1–174； UniProt 26–199

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1fcd
沉积日期 deposition_date	1994-08-18
结构标题 title	THE STRUCTURE OF FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE FROM A PURPLE PHOTOTROPHIC BACTERIUM CHROMATIUM VINOSUM AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION
关键词 keywords	ELECTRON TRANSPORT(FLAVOCYTOCHROME); ELECTRON TRANSPORT(FLAVOCYTOCHROME)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1fcd__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1fcd__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1fcd__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.67 Å
Rg（电子密度）	24.85 Å
总 Rg	25.75 Å
原子数	4501
残基数	575
排除体积	79736 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1fcd__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1fcd__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (FLAVIN-BINDING SUBUNIT)
分子量 formula_weight	42844.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	9002

AGRKVVVVGGGTGGATAAKYIKLADPSIEVTLIEPNTDYYTCYLSNEVIGGDRKLESIKHGYDGLRAHGIQVVHDSATGIDPDKKLVKTAGGAEFGYDRCVVAPGIELIYDKIEGYSEEAAAKLPHAWKAGEQTAILRKQLEDMADGGTVVIAPPAAPFRCPPGPYERASQVAYYLKAHKPMSKVIILDSSQTFSKQSQFSKGWERLYGFGTENAMIEWHPGPDSAVVKVDGGEMMVETAFGDEFKADVINLIPPQRAGKIAQIAGLTNDAGWCPVDIKTFESSIHKGIHVIGDASIANPMPKSGYSANSQGKVAAAAVVVLLKGEEPGTPSYLNTCYSILAPAYGISVAAIYRPNADGSAIESVPDSGGVTPVDAPDWVLEREVQYAYSWYNNIVHDTFG

来源 Source

来源生物 organism	Allochromatium vinosum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1049

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (CYTOCHROME SUBUNIT)
分子量 formula_weight	19231.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

EPTAEMLTNNCAGCHGTHGNSVGPASPSIAQMDPMVFVEVMEGFKSGEIASTIMGRIAKGYSTADFEKMAGYFKQQTYQPAKQSFDTALADTGAKLHDKYCEKCHVEGGKPLADEEDYHILAGQWTPYLQYAMSDFREERRPMEKKMASKLRELLKAEGDAGLDALFAFYASQQ

来源 Source

来源生物 organism	Allochromatium vinosum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1049

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (10 domains)

结构域编号 domain_id	d1fcda1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.5 — FAD/NAD-linked reductases, N-terminal and central domains

结构域编号 domain_id	d1fcda2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.5 — FAD/NAD-linked reductases, N-terminal and central domains

结构域编号 domain_id	d1fcda3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.87 — CO dehydrogenase flavoprotein C-domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.87.1 — FAD/NAD-linked reductases, dimerisation (C-terminal) domain
家族 Family family	d.87.1.1 — FAD/NAD-linked reductases, dimerisation (C-terminal) domain

结构域编号 domain_id	d1fcdb1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.5 — FAD/NAD-linked reductases, N-terminal and central domains

结构域编号 domain_id	d1fcdb2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.5 — FAD/NAD-linked reductases, N-terminal and central domains

结构域编号 domain_id	d1fcdb3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.87 — CO dehydrogenase flavoprotein C-domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.87.1 — FAD/NAD-linked reductases, dimerisation (C-terminal) domain
家族 Family family	d.87.1.1 — FAD/NAD-linked reductases, dimerisation (C-terminal) domain

结构域编号 domain_id	d1fcdc1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.4 — Two-domain cytochrome c

结构域编号 domain_id	d1fcdc2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.4 — Two-domain cytochrome c

结构域编号 domain_id	d1fcdd1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.4 — Two-domain cytochrome c

结构域编号 domain_id	d1fcdd2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.4 — Two-domain cytochrome c

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	1fcdA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	1fcdA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	1fcdA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	760 — Flavocytochrome C Sulfide Dehydrogenase; Chain A Domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase, flavin-binding domain

结构域编号 domain_id	1fcdB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	1fcdB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	1fcdB03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	760 — Flavocytochrome C Sulfide Dehydrogenase; Chain A Domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase, flavin-binding domain

结构域编号 domain_id	1fcdC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c-like domain

结构域编号 domain_id	1fcdC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c-like domain

结构域编号 domain_id	1fcdD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c-like domain

结构域编号 domain_id	1fcdD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c-like domain

▶

晶胞边长 a length_a	168.600 Å
晶胞边长 b length_b	84.600 Å
晶胞边长 c length_c	106.400 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	107.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.530 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	0.2370
R_work r_work	0.2370
R_free r_free	—

THE STRUCTURE OF FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE FROM A PURPLE PHOTOTROPHIC BACTERIUM CHROMATIUM VINOSUM AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (FLAVIN-BINDING SUBUNIT)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (CYTOCHROME SUBUNIT)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1fcd__assembly_1__model_1

1fcd__assembly_1__model_1 | I(q)

1fcd__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (10 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (3)

THE STRUCTURE OF FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE FROM A PURPLE PHOTOTROPHIC BACTERIUM CHROMATIUM VINOSUM AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (FLAVIN-BINDING SUBUNIT)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

FLAVOCYTOCHROME C SULFIDE DEHYDROGENASE (CYTOCHROME SUBUNIT)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1fcd__assembly_1__model_1

1fcd__assembly_1__model_1 | I(q)

1fcd__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (10 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (3)