1fe1

CRYSTAL STRUCTURE PHOTOSYSTEM II

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly	物理组成	蛋白状态	蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	18 / 0 / 0 / 0	与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1fe1
沉积日期 deposition_date	2000-07-20
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE PHOTOSYSTEM II
关键词 keywords	;PHOTOSYNTHESIS, PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER, CORE- ANTEN A LIGHT-HARVESTING SYSTEM, THERMOPHILIC CYANOBACTERIUM, MEMBRANE PROTEIN, PHOTOSYNTHESIS-ELECTRON TRANSPORT COMPLEX ;; PHOTOSYNTHESIS/ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1fe1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1fe1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1fe1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	58.49 Å
Rg（电子密度）	58.84 Å
总 Rg	59.45 Å
原子数	1852
残基数	0
排除体积	573910 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1fe1__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT PSBA)
分子量 formula_weight	14400.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,J
原子数 atom_count	4328

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT PSBD)
分子量 formula_weight	14826.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,K

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT PSBC)
分子量 formula_weight	13294.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,L

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT PSBB)
分子量 formula_weight	13209.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,M

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT PSBE)
分子量 formula_weight	3422.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,N

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT PSBF)
分子量 formula_weight	2571.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,O

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT UNKNOWN)
分子量 formula_weight	26570.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,P

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT PSBO)
分子量 formula_weight	9805.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,Q

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOTOSYSTEM II: SUBUNIT PSBV)
分子量 formula_weight	7422.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,R

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	TYROSINE
分子量 formula_weight	181.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	64

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	2-[(3-HYDROXY-2-METHYL-5-PHOSPHONOOXYMETHYL-PYRIDIN-4-YLMETHYL)-AMINO]-2-METHYL-SUCCINIC ACID
分子量 formula_weight	378.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	CADMIUM ION
分子量 formula_weight	112.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

结构域编号 domain_id	d1fe1a_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1b_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1c_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1d_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1e_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1f_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1g_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1h_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1i_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1j_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1k_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1l_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1m_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1n_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1o_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1p_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1q_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

结构域编号 domain_id	d1fe1r_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.5 — Photosystems
超家族 Superfamily superfamily	i.5.1 — Photosystems
家族 Family family	i.5.1.1 — Photosystems

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晶胞边长 a length_a	130.010 Å
晶胞边长 b length_b	226.720 Å
晶胞边长 c length_c	308.290 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.800 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

CRYSTAL STRUCTURE PHOTOSYSTEM II

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目的 assembly 组成

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1fe1__assembly_1__model_1

1fe1__assembly_1__model_1 | I(q)

1fe1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

实体 12 Entity 12 non-polymer

实体 13 Entity 13 non-polymer

实体 14 Entity 14 non-polymer

实体 15 Entity 15 non-polymer

实体 16 Entity 16 non-polymer

实体 17 Entity 17 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

7. 引用文献 (1)