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1feu

CRYSTAL STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEIN TL5, ONE OF THE CTC FAMILY PROTEINS, COMPLEXED WITH A FRAGMENT OF 5S RRNA.

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S RIBOSOMAL PROTEIN L25

Thermus thermophilus

UniProt P56930

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 19 NT FRAGMENT OF 5S RRNA × 1 21 NT FRAGMENT OF 5S RRNA × 1 MAGNESIUM ION × 6 CADMIUM ION × 6 water × 3 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 19 NT FRAGMENT OF 5S RRNA × 1 21 NT FRAGMENT OF 5S RRNA × 1 MAGNESIUM ION × 11 CADMIUM ION × 7 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1feu 1feu

共 2 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL25_THETH
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206 作者链 D； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1feu
沉积日期 deposition_date2000-07-23
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEIN TL5, ONE OF THE CTC FAMILY PROTEINS, COMPLEXED WITH A FRAGMENT OF 5S RRNA.
关键词 keywordsgeneral stress protein CTC, 5S rRNA-protein complex, cadmium ions, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1feu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1feu__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1feu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）23.63 Å
Rg（电子密度）23.07 Å
总 Rg23.69 Å
原子数2349
残基数225
排除体积38924 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1feu__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1feu__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1feua_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.53 — Ribosomal protein L25-like
超家族 Superfamily superfamilyb.53.1 — Ribosomal protein L25-like
家族 Family familyb.53.1.1 — Ribosomal protein L25-like
结构域编号 domain_idd1feud_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.53 — Ribosomal protein L25-like
超家族 Superfamily superfamilyb.53.1 — Ribosomal protein L25-like
家族 Family familyb.53.1.1 — Ribosomal protein L25-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1feuA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology240 — Ribosomal Protein L25; Chain P
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal Protein L25; Chain P
结构域编号 domain_id1feuA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein L25, C-terminal domain
结构域编号 domain_id1feuD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology240 — Ribosomal Protein L25; Chain P
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal Protein L25; Chain P
结构域编号 domain_id1feuD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein L25, C-terminal domain
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7. 引用文献 (1)