← 返回搜索
1fjl

HOMEODOMAIN FROM THE DROSOPHILA PAIRED PROTEIN BOUND TO A DNA OLIGONUCLEOTIDE

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PAIRED PROTEIN

Drosophila melanogaster

UniProt P06601

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(*AP*AP*TP*AP*AP*TP*CP*TP*GP*AP*TP*TP*AP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*AP*AP*TP*CP*AP*GP*AP*TP*TP*AP*T)-3') ; × 1 water × 4 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*AP*AP*TP*CP*TP*GP*AP*TP*TP*AP*C)-3') ; × 2 water × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1fjl 1fjl 1pdn

共 3 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRD_DROME
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–81； UniProt 196–276 作者链 B； PDB构建体 1–81； UniProt 196–276 作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 196–276

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1fjl
沉积日期 deposition_date1995-12-17
结构标题 titleHOMEODOMAIN FROM THE DROSOPHILA PAIRED PROTEIN BOUND TO A DNA OLIGONUCLEOTIDE
关键词 keywordsDNA-BINDING PROTEIN, DNA, PAIRED BOX, TRANSCRIPTION REGULATION, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1fjl__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1fjl__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1fjl__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）17.11 Å
Rg（电子密度）16.31 Å
总 Rg17.18 Å
原子数1564
残基数146
排除体积25686 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1fjl__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1fjl__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1fjla_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family familya.4.1.1 — Homeodomain
结构域编号 domain_idd1fjlb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family familya.4.1.1 — Homeodomain
结构域编号 domain_idd1fjlc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family familya.4.1.1 — Homeodomain

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1fjlA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
结构域编号 domain_id1fjlB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
结构域编号 domain_id1fjlC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
▶

7. 引用文献 (1)