1fn9

CRYSTAL STRUCTURE OF THE REOVIRUS OUTER CAPSID PROTEIN SIGMA 3

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

OUTER-CAPSID PROTEIN SIGMA 3

Reovirus sp.

UniProt Q98639

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ZINC ION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q98639_9REOV
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 B; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1fn9
沉积日期 deposition_date2000-08-21
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF THE REOVIRUS OUTER CAPSID PROTEIN SIGMA 3
关键词 keywordsZinc binding motif, Viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1fn9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1fn9__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1fn9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)29.98 Å
Rg(电子密度)29.02 Å
总 Rg29.60 Å
原子数5766
残基数730
排除体积102310 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1fn9__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1fn9a_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.196 — Outer capsid protein sigma 3
超家族 Superfamily superfamilyd.196.1 — Outer capsid protein sigma 3
家族 Family familyd.196.1.1 — Outer capsid protein sigma 3
结构域编号 domain_idd1fn9b_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.196 — Outer capsid protein sigma 3
超家族 Superfamily superfamilyd.196.1 — Outer capsid protein sigma 3
家族 Family familyd.196.1.1 — Outer capsid protein sigma 3

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1fn9A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1630 — Outer-capsid protein sigma 3, small lobe
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Outer-capsid protein sigma 3, small lobe
结构域编号 domain_id1fn9A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1320 — Outer-capsid protein sigma 3, large lobe
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Outer-capsid protein sigma 3, large lobe
结构域编号 domain_id1fn9B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1630 — Outer-capsid protein sigma 3, small lobe
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Outer-capsid protein sigma 3, small lobe
结构域编号 domain_id1fn9B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1320 — Outer-capsid protein sigma 3, large lobe
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Outer-capsid protein sigma 3, large lobe

7. 引用文献 (1)