SAXSdb — 1fs0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE EPSILON SUBUNIT

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–138	未记录	ATP SYNTHASE GAMMA SUBUNIT × 1 （P0ABA6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；298 K；0.5M tartrate, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.269
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–138	未记录	ATP SYNTHASE GAMMA SUBUNIT × 2 （P0ABA6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；298 K；0.5M tartrate, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.269

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1FS0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AQT EPSILON SUBUNIT OF F1F0-ATP SYNTHASE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–138（136 aa）片段：EPSILON CHAIN	突变：A1G, M2S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；PROTEIN (4 MG/ML)IN 50 MM HEPES BUFFER, PH 7.5, 200 MM (NH2)2SO4, 2 M (NA/K)PO4	分辨率 2.30 Å R-free 0.288
1BSH SOLUTION STRUCTURE OF THE EPSILON SUBUNIT OF THE F1-ATPSYNTHASE FROM ESCHERICHIA COLI AND ORIENTATION OF THE SUBUNIT RELATIVE TO THE BETA SUBUNITS OF THE COMPLEX 提交 1998-08-27	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0.03；压力 10000	分辨率未提供
1BSN SOLUTION STRUCTURE OF THE EPSILON SUBUNIT OF THE F1-ATPSYNTHASE FROM ESCHERICHIA COLI AND ORIENTATION OF THE SUBUNIT RELATIVE TO THE BETA SUBUNITS OF THE COMPLEX 提交 1998-08-28	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0.03；压力 10000	分辨率未提供

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPE_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–138； UniProt 1–138

ATP SYNTHASE GAMMA SUBUNIT

物种未注明

UniProt P0ABA6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 19–248	未记录	ATP SYNTHASE EPSILON SUBUNIT × 1 （P0A6E6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；298 K；0.5M tartrate, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.269
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 19–248	未记录	ATP SYNTHASE EPSILON SUBUNIT × 2 （P0A6E6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；298 K；0.5M tartrate, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.269

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPG_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–230； UniProt 19–248

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1fs0
沉积日期 deposition_date	2000-09-07
结构标题 title	COMPLEX OF GAMMA/EPSILON ATP SYNTHASE FROM E.COLI
关键词 keywords	ATP Synthase, Coiled coil, Gamma, epsilon, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.95 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	22.22 Å
零角强度 I(0) i0	24984000.00
分子量 molecular_weight	38398.0 kDa
排除体积 excluded_volume	48299 Å³
包络体积 envelope_volume	57997 Å³
水化壳体积 shell_volume	22313 Å³
包络直径 envelope_diameter	75.0 Å
壳层 Rg shell_rg	28.65 Å
包络 Rg envelope_rg	22.59 Å
形状 Rg shape_rg	22.20 Å
总 Rg total_rg	23.11 Å
总原子数 total_atoms	2691
残基数 n_residues	347
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	73.4 Å
Rg (实空间) rg_real	22.95 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.4980e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4690e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.95 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	24980000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8985
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	26.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.356
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.333
角度范围 angular_range	— – 0.3450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5108000.0000
实空间数据点数 n_real_points	66
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.912; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.944

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE EPSILON SUBUNIT
分子量 formula_weight	14956.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E
原子数 atom_count	2945

AMTYHLDVVSAEQQMFSGLVEKIQVTGSEGELGIYPGHAPLLTAIKPGMIRIVKQHGHEEFIYLSGGILEVQPGNVTVLADTAIRGQDLDEARAMEAKRKAEEHISSSHGDVDYAQASAELAKAIAQLRVIELTKKAM

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE GAMMA SUBUNIT
分子量 formula_weight	25683.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

KITKAMEMVAASKMRKSQDRMAASRPYAETMRKVIGHLAHGNLEYKHPYLEDRDVKRVGYLVVSTDRGLCGGLNINLFKKLLAEMKTWTDKGVQCDLAMIGSKGVSFFNSVGGNVVAQVTGMGDNPSLSELIGPVKVMLQAYDEGRLDKLYIVSNKFINTMSQVPTISQLLPLPASDDDDLKHKSWDYLYEPDPKALLDTLLRRYVESQVYQGVVENLASEQAARMVAMK

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	254

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1fs0e1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamily	a.2.10 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain
家族 Family family	a.2.10.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1fs0e2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.93 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	b.93.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
家族 Family family	b.93.1.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1fs0g_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.49 — Pyruvate kinase C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.49.2 — ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit
家族 Family family	c.49.2.1 — ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1fs0E01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	15 — ATP Synthase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F0F1 ATP synthase delta/epsilon subunit, N-terminal

结构域编号 domain_id	1fs0E02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	440 — ATP synthase delta/epsilon subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1fs0G01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1380 — Pyruvate Kinase; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATP synthase, F1 complex, gamma subunit

结构域编号 domain_id	1fs0G02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — ATP synthase, gamma subunit, helix hairpin domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	76.720 Å
晶胞边长 b length_b	176.090 Å
晶胞边长 c length_c	67.070 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2270
R_work r_work	0.2160
R_free r_free	0.2690

fit	/app/data/saxs_computation/fs/1fs0/1fs0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/fs/1fs0/1fs0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/fs/1fs0/1fs0.dat

COMPLEX OF GAMMA/EPSILON ATP SYNTHASE FROM E.COLI

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE EPSILON SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP SYNTHASE GAMMA SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)