1fs2

INSIGHTS INTO SCF UBIQUITIN LIGASES FROM THE STRUCTURE OF THE SKP1-SKP2 COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SKP2

Homo sapiens

UniProt Q13309

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 SKP1 × 2 (P63208) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SKP2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–272; UniProt 89–398 作者链 C; PDB构建体 1–272; UniProt 89–398

SKP1

Homo sapiens

UniProt P63208

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 SKP2 × 2 (Q13309) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SKP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–141; UniProt 1–146 作者链 D; PDB构建体 1–141; UniProt 1–146

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1fs2
沉积日期 deposition_date2000-09-08
结构标题 titleINSIGHTS INTO SCF UBIQUITIN LIGASES FROM THE STRUCTURE OF THE SKP1-SKP2 COMPLEX
关键词 keywordsSkp1, Skp2, F-box, LRRs, leucine-rich repeats, SCF, ubiquitin, E3, ubiquitin protein ligase, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1fs2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1fs2__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1fs2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)37.81 Å
Rg(电子密度)38.79 Å
总 Rg38.69 Å
原子数6035
残基数774
排除体积108370 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1fs2__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd1fs2a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.158 — F-box domain
超家族 Superfamily superfamilya.158.1 — F-box domain
家族 Family familya.158.1.1 — F-box domain
结构域编号 domain_idd1fs2a2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamilyc.10.1 — RNI-like
家族 Family familyc.10.1.3 — Cyclin A/CDK2-associated p19, Skp2
结构域编号 domain_idd1fs2b1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.157 — Skp1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.157.1 — Skp1 dimerisation domain-like
家族 Family familya.157.1.1 — Skp1 dimerisation domain-like
结构域编号 domain_idd1fs2b2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.42 — POZ domain
超家族 Superfamily superfamilyd.42.1 — POZ domain
家族 Family familyd.42.1.1 — BTB/POZ domain
结构域编号 domain_idd1fs2c1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.158 — F-box domain
超家族 Superfamily superfamilya.158.1 — F-box domain
家族 Family familya.158.1.1 — F-box domain
结构域编号 domain_idd1fs2c2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamilyc.10.1 — RNI-like
家族 Family familyc.10.1.3 — Cyclin A/CDK2-associated p19, Skp2
结构域编号 domain_idd1fs2d1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.157 — Skp1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.157.1 — Skp1 dimerisation domain-like
家族 Family familya.157.1.1 — Skp1 dimerisation domain-like
结构域编号 domain_idd1fs2d2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.42 — POZ domain
超家族 Superfamily superfamilyd.42.1 — POZ domain
家族 Family familyd.42.1.1 — BTB/POZ domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1fs2A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribonuclease Inhibitor
结构域编号 domain_id1fs2B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
结构域编号 domain_id1fs2C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribonuclease Inhibitor
结构域编号 domain_id1fs2D00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
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7. 引用文献 (1)