1ftc

Y13C MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII FDI

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 92.7 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FERREDOXIN

Azotobacter vinelandii

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–106	突变：Y13C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.35 Å
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–106	突变：Y13C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.35 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1FTC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A6L T14C MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII FDI 提交 1998-02-26	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	突变：T14C	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；pH 7.8	分辨率 2.10 Å
1AXQ FERRICYANIDE OXIDIZED FDI 提交 1997-10-17	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；4.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.45 M TRIS-HCL PH 7.8	分辨率 2.10 Å
1B0T D15K/K84D MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII FDI 提交 1998-11-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–107（106 aa）	突变：D15K AND K84D	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；pH 7.8	分辨率 2.10 Å
1B0V I40N MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII FDI 提交 1998-11-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	突变：I40N	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å
1B0V I40N MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII FDI 提交 1998-11-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–106（106 aa）	突变：I40N	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å
1B0V I40N MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII FDI 提交 1998-11-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–106（106 aa）	突变：I40N	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å
1B0V I40N MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII FDI 提交 1998-11-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–106（106 aa）	突变：I40N	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å
1D3W Crystal structure of ferredoxin 1 d15e mutant from azotobacter vinelandii at 1.7 angstrom resolution. 提交 1999-10-01	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–107（106 aa）	突变：D15E	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；.4M TRIS PH 7.8, 1.2 M AMMONIUM SULPHATE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.70 Å R-free 0.247
1F5B CRYSTAL STRUCTURE OF F2H FERREDOXIN 1 MUTANT FROM AZOTOBACTER VINELANDII AT 1.75 ANGSTROM RESOLUTION 提交 2000-06-13	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	突变：F2H	F3S FE3-S4 CLUSTER × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；277 K；Trizma base, ammonium sulfate, potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 1.62 Å R-free 0.244
1F5C CRYSTAL STRUCTURE OF F25H FERREDOXIN 1 MUTANT FROM AZOTOBACTER VINELANDII AT 1.75 ANGSTROM RESOLUTION 提交 2000-06-13	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	突变：F25H	SO4 SULFATE ION × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；277 K；Trizma base, ammonium sulfate, potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
1FD2 SITE-DIRECTED MUTAGENESIS OF AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN I. (FE-S) CLUSTER-DRIVEN PROTEIN REARRANGEMENT 提交 1988-12-08	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1FDA CRYSTAL STRUCTURES OF OXIDIZED AND REDUCED AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN AT PH 8 AND PH 6 提交 1993-06-29	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1FDB CRYSTAL STRUCTURES OF OXIDIZED AND REDUCED AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN AT PH 8 AND PH 6 提交 1993-06-29	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
1FDD AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN I: ASPARTATE 15 FACILITATES PROTON TRANSFER TO THE REDUCED [3FE-4S] CLUSTER 提交 1993-01-17	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1FER STRUCTURE AT PH 6.5 OF FERREDOXIN I FROM AZOTOBACTER VINELANDII AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-09-02	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	F3S FE3-S4 CLUSTER × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1FF2 CRYSTAL STRUCTURE OF THE C42D MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII 7FE FERREDOXIN (FDI) 提交 2000-07-24	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	突变：C42D	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；277 K；Ammonium sulfate, Tris-HCL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K	分辨率 2.30 Å R-free 0.269
1FRH AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN I: ALTERATION OF INDIVIDUAL SURFACE CHARGES AND THE [4FE-4S] CLUSTER REDUCTION POTENTIAL 提交 1993-09-27	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1FRI AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN I: ALTERATION OF INDIVIDUAL SURFACE CHARGES AND THE [4FE-4S] CLUSTER REDUCTION POTENTIAL 提交 1993-09-27	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1FRJ AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN I: ALTERATION OF INDIVIDUAL SURFACE CHARGES AND THE [4FE-4S] CLUSTER REDUCTION POTENTIAL 提交 1993-09-27	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1FRK AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN I: ALTERATION OF INDIVIDUAL SURFACE CHARGES AND THE [4FE-4S] CLUSTER REDUCTION POTENTIAL 提交 1993-09-27	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1FRL AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN I: ALTERATION OF INDIVIDUAL SURFACE CHARGES AND THE [4FE-4S] CLUSTER REDUCTION POTENTIAL 提交 1993-09-27	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1FRM AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN I: ALTERATION OF INDIVIDUAL SURFACE CHARGES AND THE [4FE-4S] CLUSTER REDUCTION POTENTIAL 提交 1993-09-27	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1FRX STRUCTURE AND PROPERTIES OF C20S FDI MUTANT 提交 1994-07-13	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1G3O CRYSTAL STRUCTURE OF V19E MUTANT OF FERREDOXIN I 提交 2000-10-24	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；Ammonium sulfate, tris buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K	分辨率 1.65 Å R-free 0.265
1G6B CRYSTAL STRUCTURE OF P47S MUTANT OF FERREDOXIN I 提交 2000-11-03	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；Ammonium sulfate, tris buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
1GAO CRYSTAL STRUCTURE OF THE L44S MUTANT OF FERREDOXIN I 提交 2000-11-30	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；Ammonium sulfate, Lithium sulfate, Tris buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.286
1GAO CRYSTAL STRUCTURE OF THE L44S MUTANT OF FERREDOXIN I 提交 2000-11-30	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；Ammonium sulfate, Lithium sulfate, Tris buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.286
1GAO CRYSTAL STRUCTURE OF THE L44S MUTANT OF FERREDOXIN I 提交 2000-11-30	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；Ammonium sulfate, Lithium sulfate, Tris buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.286
1GAO CRYSTAL STRUCTURE OF THE L44S MUTANT OF FERREDOXIN I 提交 2000-11-30	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；Ammonium sulfate, Lithium sulfate, Tris buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.286
1PC4 Crystal Structure of the P50A mutant of ferredoxin I at 1.65 A Resolution 提交 2003-05-15	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 0–106（107 aa）	突变：P50A	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；298 K；Tris-HCl, Ammonium Sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 1.65 Å R-free 0.238
1PC5 Crystal Structure of the P50G Mutant of Ferredoxin I at 1.8 A Resolution 提交 2003-05-15	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 0–106（107 aa）	突变：P50G	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；298 K；Tris-HCl, Ammonium Sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.253
2FD2 CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF TWO SITE-DIRECTED MUTANTS OF AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN 提交 1990-08-20	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
5FD1 CRYSTAL STRUCTURES OF OXIDIZED AND REDUCED AZOTOBACTER VINELANDII FERREDOXIN AT PH 8 AND PH 6 提交 1993-06-29	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
6FD1 7-FE FERREDOXIN FROM AZOTOBACTER VINELANDII LOW TEMPERATURE, 1.35 A 提交 1997-09-17	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；PROTEIN CRYSTALLIZED FROM 4.8M AMMONIUM SULFATE, 0.45M TRIS-HCL, PH 7.8	分辨率 1.35 Å R-free 0.213
6FDR 7-FE FERREDOXIN FROM AZOTOBACTER VINELANDII AT 100K, NA DITHIONITE REDUCED AT PH 8.5, RESOLUTION 1.4 A 提交 1998-12-11	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；PROTEIN CRYSTALLIZED FROM 60% SAT. AMMONIUM SULFATE, 0.4M TRIS-HCL, PH 7.8. CRYSTALS WERE SOAKED IN 5MM NA DITHIONITE, 0.15M TRIS/HCL PH 8.5 BEFORE DATA COLLECTION	分辨率 1.40 Å
7FD1 7-FE FERREDOXIN FROM AZOTOBACTER VINELANDII AT PH 8.5, 100 K, 1.35 A 提交 1998-12-11	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；PROTEIN CRYSTALLIZED FROM 60% SAT. AMMONIUM SULFATE, 0.4M TRIS-HCL, PH 7.8 THE CRYSTALS WERE SOAKED IN 0.15M TRIS/HCL PH 8.5 BEFORE DATA COLLECTION. STARTING MODEL IN THE REFINEMENT WAS PDB ENTRY 6FD1.	分辨率 1.30 Å
7FDR 7-FE FERREDOXIN FROM AZOTOBACTER VINELANDII, NA DITHIONITE REDUCED, PH 8.5, 1.4A RESOLUTION, 100 K 提交 1998-12-11	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 F3S FE3-S4 CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；PROTEIN CRYSTALLIZED FROM 60% SAT. AMMONIUM SULFATE, 0.4M TRIS-HCL, PH 7.8	分辨率 1.40 Å

共 31 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FER1_AZOVI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–106； UniProt 1–106 作者链 B； PDB构建体 1–106； UniProt 1–106

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ftc
沉积日期 deposition_date	1997-01-08
结构标题 title	Y13C MUTANT OF AZOTOBACTER VINELANDII FDI
关键词 keywords	ELECTRON TRANSPORT, IRON-SULFUR; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	29.32 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.66 Å
零角强度 I(0) i0	12517100.00
分子量 molecular_weight	25306.0 kDa
排除体积 excluded_volume	30376 Å³
包络体积 envelope_volume	40071 Å³
水化壳体积 shell_volume	11359 Å³
包络直径 envelope_diameter	87.7 Å
壳层 Rg shell_rg	36.63 Å
包络 Rg envelope_rg	27.72 Å
形状 Rg shape_rg	28.63 Å
总 Rg total_rg	29.49 Å
总原子数 total_atoms	1702
残基数 n_residues	210
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	92.7 Å
Rg (实空间) rg_real	29.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.10 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.2520e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.0270e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	29.49 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	12520000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6196
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	17.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.146
峰度 Kurtosis kurtosis	-1.467
角度范围 angular_range	— – 0.2700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	778700.0000
实空间数据点数 n_real_points	55
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.002; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.045; Smooth: 0.999

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FERREDOXIN
分子量 formula_weight	12031.6 kDa
突变 mutation	Y13C
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	1702

AFVVTDNCIKCKCTDCVEVCPVDCFYEGPNFLVIHPDECIDCALCEPECPAQAIFSEDEVPEDMQEFIQLNAELAEVWPNITEKKDPLPDAEDWDGVKGKLQHLER

来源 Source

来源生物 organism	Azotobacter vinelandii
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	354
宿主生物 host_organism	Azotobacter vinelandii

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	FE3-S4 CLUSTER
分子量 formula_weight	295.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1ftca_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.1 — 4Fe-4S ferredoxins
家族 Family family	d.58.1.2 — 7-Fe ferredoxin

结构域编号 domain_id	d1ftcb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.1 — 4Fe-4S ferredoxins
家族 Family family	d.58.1.2 — 7-Fe ferredoxin

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1ftcA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1ftcB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	39.300 Å
晶胞边长 b length_b	73.700 Å
晶胞边长 c length_c	45.100 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	98.40 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.350 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	0.2160
R_work r_work	0.2160
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/ft/1ftc/1ftc.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ft/1ftc/1ftc.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ft/1ftc/1ftc.dat