1g6q

CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST ARGININE METHYLTRANSFERASE, HMT1

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HNRNP ARGININE N-METHYLTRANSFERASE

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 6	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
4	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HMT1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–328； UniProt 21–348 作者链 2； PDB构建体 1–328； UniProt 21–348 作者链 3； PDB构建体 1–328； UniProt 21–348 作者链 4； PDB构建体 1–328； UniProt 21–348 作者链 5； PDB构建体 1–328； UniProt 21–348 作者链 6； PDB构建体 1–328； UniProt 21–348

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1g6q
沉积日期 deposition_date	2000-11-07
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST ARGININE METHYLTRANSFERASE, HMT1
关键词 keywords	SAM-binding domain, beta-barrel, mixed alpha-beta, hexamer, dimer, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1g6q__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1g6q__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1g6q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.89 Å
Rg（电子密度）	39.39 Å
总 Rg	39.99 Å
原子数	15520
残基数	1926
排除体积	276870 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1g6q__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1g6q__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1g6q__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1g6q__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1g6q1_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family family	c.66.1.6 — Arginine methyltransferase

结构域编号 domain_id	d1g6q2_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family family	c.66.1.6 — Arginine methyltransferase

结构域编号 domain_id	d1g6q3_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family family	c.66.1.6 — Arginine methyltransferase

结构域编号 domain_id	d1g6q4_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family family	c.66.1.6 — Arginine methyltransferase

结构域编号 domain_id	d1g6q5_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family family	c.66.1.6 — Arginine methyltransferase

结构域编号 domain_id	d1g6q6_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family family	c.66.1.6 — Arginine methyltransferase

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	1g6q101
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	1g6q102
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	1g6q201
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	1g6q202
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	1g6q301
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	1g6q302
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	1g6q401
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	1g6q402
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	1g6q501
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	1g6q502
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	1g6q601
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	1g6q602
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

▶

晶胞边长 a length_a	84.100 Å
晶胞边长 b length_b	129.430 Å
晶胞边长 c length_c	101.430 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	102.74 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	28.000 Å
R 因子 r_factor	0.2530
R_work r_work	0.2530
R_free r_free	0.2940

描述 description	HNRNP ARGININE N-METHYLTRANSFERASE
分子量 formula_weight	37692.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.-
突变 mutation	Q21D, H22Y, N25D
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,2,3,4,5,6
原子数 atom_count	15520

CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST ARGININE METHYLTRANSFERASE, HMT1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HNRNP ARGININE N-METHYLTRANSFERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1g6q__assembly_1__model_1

1g6q__assembly_1__model_1 | I(q)

1g6q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (5)

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST ARGININE METHYLTRANSFERASE, HMT1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HNRNP ARGININE N-METHYLTRANSFERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1g6q__assembly_1__model_1

1g6q__assembly_1__model_1 | I(q)

1g6q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (5)