1ge9

SOLUTION STRUCTURE OF THE RIBOSOME RECYCLING FACTOR

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RIBOSOME RECYCLING FACTOR

Aquifex aeolicus

UniProt O66928

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RRF_AQUAE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–184; UniProt 1–184

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ge9
沉积日期 deposition_date2000-10-19
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF THE RIBOSOME RECYCLING FACTOR
关键词 keywordsTHREE-HELIX BUNDLE, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ge9__assembly_1__model_4

Assembly 1 · Model 4 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ge9__assembly_1__model_4 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ge9__assembly_1__model_4 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.66 Å
Rg(电子密度)22.02 Å
总 Rg22.77 Å
原子数3087
残基数184
排除体积27094 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ge9__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1ge9__assembly_1__model_2 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1ge9__assembly_1__model_3 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1ge9__assembly_1__model_4 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1ge9__assembly_1__model_5 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1ge9__assembly_1__model_6 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1ge9__assembly_1__model_7 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1ge9__assembly_1__model_8 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1ge9__assembly_1__model_9 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1ge9__assembly_1__model_10 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 1ge9__assembly_1__model_11 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 1ge9__assembly_1__model_12 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 1ge9__assembly_1__model_13 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 1ge9__assembly_1__model_14 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 1ge9__assembly_1__model_15 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1ge9a_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.67 — RRF/tRNA synthetase additional domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.67.3 — Ribosome recycling factor, RRF
家族 Family familyd.67.3.1 — Ribosome recycling factor, RRF

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1ge9A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosome-recycling factor
结构域编号 domain_id1ge9A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40

7. 引用文献 (1)