SAXSdb — 1h2m

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FACTOR INHIBITING HIF1

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–349	未记录	HYPOXIA-INDUCIBLE FACTOR 1 ALPHA × 2 （Q16665） ZN ZINC ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM ZN(II), 2.5MM NOG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.225

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1H2M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1H2K Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide 提交 2002-08-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–349（349 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, ARGON ATMOSPHERE, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II), 2.5MM NOG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50	分辨率 2.15 Å R-free 0.213
1H2L Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide 提交 2002-08-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–349（349 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 2 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, ARGON ATMOSPHERE, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II), 2.5MM AKG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50	分辨率 2.25 Å R-free 0.217

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q969Q7
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–349； UniProt 1–349

HYPOXIA-INDUCIBLE FACTOR 1 ALPHA

HOMO SAPIENS

UniProt Q16665

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 S； UniProt 775–826	片段：C-TERMINAL TRANSACTIVATION DOMAIN FRAGMENT, RESIDUES 775-826	FACTOR INHIBITING HIF1 × 2 （Q969Q7） ZN ZINC ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM ZN(II), 2.5MM NOG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.225

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1H2M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1H2K Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide 提交 2002-08-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 S 786–826（41 aa）片段：C-TERMINAL TRANSACTIVATION DOMAIN FRAGMENT, RESIDUES 786-826	未记录	FE2 FE (II) ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, ARGON ATMOSPHERE, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II), 2.5MM NOG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50	分辨率 2.15 Å R-free 0.213
1H2L Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide 提交 2002-08-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 S 786–826（41 aa）片段：C-TERMINAL TRANSACTIVATION DOMAIN FRAGMENT, RESIDUES 786-826	未记录	FE2 FE (II) ION × 2 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, ARGON ATMOSPHERE, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II), 2.5MM AKG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50	分辨率 2.25 Å R-free 0.217
1L3E NMR Structures of the HIF-1alpha CTAD/p300 CH1 Complex 提交 2002-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 785–826（42 aa）片段：C-terminal transactivation domain (CTAD)	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 90% D2O, 10% H2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 90% D2O, 10% H2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex 10% U-13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O	分辨率未提供
1L8C STRUCTURAL BASIS FOR HIF-1ALPHA/CBP RECOGNITION IN THE CELLULAR HYPOXIC RESPONSE 提交 2002-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 776–826（51 aa）片段：CTAD (C-Terminal activation) domain, Residues 776-826	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）2.0 Millimolar；压力 Ambient NMR样品组成 1MM 13C, 15N-TAZ1, 2MM HIF-1a NMR样品组成 1MM 13C, 15N-HIF-1a, 2MM TAZ1 NMR样品组成 10MM D-TRIS, 10MM D-DTT, 0.02% NAN3, 0.5MM ZnSO4	分辨率未提供
1LM8 Structure of a HIF-1a-pVHL-ElonginB-ElonginC Complex 提交 2002-04-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 556–575（20 aa）片段：Residues 556-575	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.85 Å R-free 0.236
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 549–582（34 aa）片段：residues 549-582	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 549–582（34 aa）片段：residues 549-582	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.277
2ILM Factor Inhibiting HIF-1 Alpha D201A Mutant in Complex with FE(II), Alpha-Ketoglutarate and HIF-1 Alpha 35mer 提交 2006-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 S 786–826（41 aa）片段：CTAD	未记录	FE2 FE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 BCT BICARBONATE ION × 2 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；1.6M AMMONIUM SULPHATE, 6% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5 ARGON ATMOSPHERE, 14MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II)SO4, 1MM ALPHA-KETOGLUTARATE, 1MM HIF-1ALPHA PEPTIDE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298.0K, pH 7.50	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
3HQR PHD2:Mn:NOG:HIF1-alpha substrate complex 提交 2009-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 558–574（17 aa）片段：C-terminal degradation domain, residues 558-574	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200mM MgCl2, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.248
3HQU PHD2:Fe:UN9:partial HIF1-alpha substrate complex 提交 2009-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 558–574（17 aa）片段：C-terminal degradation domain, residues 558-574	未记录	FE2 FE (II) ION × 1 UN9 N-[(1-CHLORO-4-HYDROXYISOQUINOLIN-3-YL)CARBONYL]GLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6.5；298 K；1.6M AMMONIUM SULFATE, 4% DIOXANE, 0.1M MES PH6.5, ARGON ATMOSPHERE, 20MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II)SO4, 10MM HIF1A-CODD-OH PEPTIDE, hanging drop, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.222
4AJY von Hippel-Lindau protein-ElonginB-ElonginC complex, bound to Hif1- alpha peptide 提交 2012-02-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 559–577（19 aa）片段：RESIDUES 559-577	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M K PHOSPHATE PH 6.6 0.2 M (NH4)2SO4 20% PEG MME 5000 5 MM DTT	分辨率 1.73 Å R-free 0.232
4H6J Identification of Cys 255 in HIF-1 as a novel site for development of covalent inhibitors of HIF-1 /ARNT PasB domain protein-protein interaction. 提交 2012-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 238–348（111 aa）片段：PAS-B DOMAIN, UNP residues 238-348	突变：R245E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG 8000, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris pH 8.5 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.52 Å R-free 0.248
5JWP Crystal structure of human FIH D201E variant in complex with Zn, alpha-ketoglutarate, and HIF1 alpha peptide. 提交 2016-05-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 788–806（19 aa）片段：UNP residues 11-29	未记录	AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes, 1.6mM ammonium sulfate, 3% PEG 400	分辨率 2.10 Å R-free 0.209
5L9B HIF PROLYL HYDROXYLASE 2 (PHD2/ EGLN1) IN COMPLEX WITH 2-OXOGLUTARATE (2OG) AND HIF-1ALPHA CODD (556-574) 提交 2016-06-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 556–574（19 aa）片段：UNP residues 556-574	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.186
5L9B HIF PROLYL HYDROXYLASE 2 (PHD2/ EGLN1) IN COMPLEX WITH 2-OXOGLUTARATE (2OG) AND HIF-1ALPHA CODD (556-574) 提交 2016-06-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 556–574（19 aa）片段：UNP residues 556-574	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.186
5L9V HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/P317C) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-1) 提交 2016-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 395–413（19 aa）片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP RESIDUES 395-413	突变：L397C, D412C	MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M ammonium chloride, 20 % w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 1.83 Å R-free 0.190
5L9V HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/P317C) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-1) 提交 2016-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 395–413（19 aa）片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP RESIDUES 395-413	突变：L397C, D412C	MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M ammonium chloride, 20 % w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 1.83 Å R-free 0.190
5LA9 HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/V314C) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-2) 提交 2016-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 395–413（19 aa）片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP residues 395-413	突变：L397C, D412C	MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 2.0 M ammonium sulfate	分辨率 2.81 Å R-free 0.279
5LA9 HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/V314C) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-2) 提交 2016-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 395–413（19 aa）片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP residues 395-413	突变：L397C, D412C	MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 2.0 M ammonium sulfate	分辨率 2.81 Å R-free 0.279
5LAS HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/P317C/R396T) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-3) 提交 2016-06-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 395–413（19 aa）片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP RESIDUES 395-413; 链 D 395–413（19 aa）片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP RESIDUES 395-413;	突变：L397C, D412C 突变：L397C, D412C	MN MANGANESE (II) ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M citrate pH 5.0, 20 % w/v polyethylene glycol 6000	分辨率 2.10 Å R-free 0.221
6YW3 HIF PROLYL HYDROXYLASE 2 (PHD2/ EGLN1) in complex with N-Oxalyl Glycine (NOG), HIF-1ALPHA CODD (556-574) and a RaPID-derived cyclic peptide 3C (14-mer) 提交 2020-04-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 S 556–574（19 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Sample: 1.0 mM cPHD2, 1.5 mM MnCl2, 2.0 mM compound, 1.0 mM 3C, 2.0 mM CODD; Reservoir: 19-23% w/v polyethylene glycol 3350, 0.25 M lithium sulfate, 2 mM MnCl2; Sitting drop (2 ul), protein-to-well ratio, 1:1	分辨率 2.28 Å R-free 0.208
7LVS The CBP TAZ1 Domain in Complex with a CITED2-HIF-1-Alpha Fusion Peptide 提交 2021-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 796–826（31 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 6.87, 28% PEG 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.241
7QGS Crystal structure of p300 CH1 domain in complex with CITIF (a CITED2-HIF-1alpha hybrid) 提交 2021-12-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 792–826（35 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M HEPES pH 6.5, PEG 6K 35%	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
8HE0 Crystal structure of importin-alpha1 bound to the HIF-1alpha nuclear localization signal (wild-type) 提交 2022-11-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 717–757（41 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；tri-sodium citrate, HEPES, DTT	分辨率 1.80 Å R-free 0.198
9OFU Dimer of HIF-1a-ARNT Heterodimers Complexed on 52-bp HRE/HAS 提交 2025-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 3–361（359 aa）链 C 3–361（359 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50mM HEPES, 150mM NaCl, 5mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

共 21 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HIFA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–52； UniProt 775–826

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1h2m
沉积日期 deposition_date	2002-08-12
结构标题 title	Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide
关键词 keywords	;TRANSCRIPTION ACTIVATOR-INHIBITOR COMPLEX, FIH, HIF, DSBH, OXYGENASE, TRANSCRIPTION, HYPOXIA, 2- OXOGLUTARATE, ASPARAGINYL HYDROXYLASE, HYDROXYLASE ;; TRANSCRIPTION ACTIVATOR/INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.55 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.36 Å
零角强度 I(0) i0	28826300.00
分子量 molecular_weight	40817.0 kDa
排除体积 excluded_volume	50812 Å³
包络体积 envelope_volume	60687 Å³
水化壳体积 shell_volume	24254 Å³
包络直径 envelope_diameter	72.3 Å
壳层 Rg shell_rg	27.69 Å
包络 Rg envelope_rg	20.83 Å
形状 Rg shape_rg	20.33 Å
总 Rg total_rg	21.40 Å
总原子数 total_atoms	2880
残基数 n_residues	354
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	70.5 Å
Rg (实空间) rg_real	21.43 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.35 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.8830e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.5520e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.45 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	28830000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8778
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.236
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.246
角度范围 angular_range	— – 0.3700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6784000.0000
实空间数据点数 n_real_points	69
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.808; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.985

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FACTOR INHIBITING HIF1
分子量 formula_weight	40328.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2979

MAATAAEAVASGSGEPREEAGALGPAWDESQLRSYSFPTRPIPRLSQSDPRAEELIENEEPVVLTDTNLVYPALKWDLEYLQENIGNGDFSVYSASTHKFLYYDEKKMANFQNFKPRSNREEMKFHEFVEKLQDIQQRGGEERLYLQQTLNDTVGRKIVMDFLGFNWNWINKQQGKRGWGQLTSNLLLIGMEGNVTPAHYDEQQNFFAQIKGYKRCILFPPDQFECLYPYPVHHPCDRQSQVDFDNPDYERFPNFQNVVGYETVVGPGDVLYIPMYWWHHIESLLNGGITITVNFWYKGAPTPKRIEYPLKAHQKVAIMRNIEKMLGEALGNPQEVGPLLNTMIKGRYN

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	HYPOXIA-INDUCIBLE FACTOR 1 ALPHA
分子量 formula_weight	5662.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

PSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	N-OXALYLGLYCINE
分子量 formula_weight	147.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	99

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1h2ma_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.82 — Double-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.82.2 — Clavaminate synthase-like
家族 Family family	b.82.2.6 — Hypoxia-inducible factor HIF ihhibitor (FIH1)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1h2mA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Jelly Rolls

结构域编号 domain_id	1h2mA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1010 — Clavaminate synthase-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	86.249 Å
晶胞边长 b length_b	86.249 Å
晶胞边长 c length_c	148.260 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	18.000 Å
R 因子 r_factor	0.1940
R_work r_work	0.1920
R_free r_free	0.2250

fit	/app/data/saxs_computation/h2/1h2m/1h2m.fit
pddf	/app/data/pr_computation/h2/1h2m/1h2m.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/h2/1h2m/1h2m.dat

Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FACTOR INHIBITING HIF1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

HYPOXIA-INDUCIBLE FACTOR 1 ALPHA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)