1hcs

NMR STRUCTURE OF THE HUMAN SRC SH2 DOMAIN COMPLEX

Method: SOLUTION NMR Dmax: 49.8 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HUMAN SRC

Homo sapiens

UniProt P12931

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 143–248 未记录 ACETYL-PYEEIE-OH × 1 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 76 个其他 PDB 条目、101 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SRC_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 2–107; UniProt 143–248

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1hcs

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1hcs
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1hcs
沉积日期 deposition_date1994-09-02
结构标题 titleNMR STRUCTURE OF THE HUMAN SRC SH2 DOMAIN COMPLEX
关键词 keywordsHUMAN PP60C-SRC SH2 DOMAIN, COMPLEX (SIGNAL TRANSDUCTION-PEPTIDE) COMPLEX; COMPLEX (SIGNAL TRANSDUCTION/PEPTIDE)
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.33
回转半径 Rg (电子) rg_electron13.75
零角强度 I(0) i03758040.00
分子量 molecular_weight13092.0 kDa
排除体积 excluded_volume16211 ų
包络体积 envelope_volume19429 ų
水化壳体积 shell_volume11979 ų
包络直径 envelope_diameter49.8
壳层 Rg shell_rg19.55
包络 Rg envelope_rg14.30
形状 Rg shape_rg13.71
总 Rg total_rg15.12
总原子数 total_atoms1811
残基数 n_residues111
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax49.8
Rg (实空间) rg_real15.23
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.28
I(0) (实空间) i0_real3.7580e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.3380e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal15.24
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3758000.0000
解质量估计 total_estimate0.8803
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary20.2
偏度 Skewness skewness0.181
峰度 Kurtosis kurtosis-0.256
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha920300.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.819; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.983

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1hcsb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.93 — SH2-like
超家族 Superfamily superfamilyd.93.1 — SH2 domain
家族 Family familyd.93.1.1 — SH2 domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1hcsB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology505 — SHC Adaptor Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SH2 domain

8. 引用文献 (6)

9. 文件与曲线 (10)