SAXSdb — 1hlb

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMOGLOBIN (DEOXY)

Caudina arenicola

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLBC_CAUAR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–158； UniProt 1–157

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1hlb
沉积日期 deposition_date	1994-03-22
结构标题 title	Structural analysis of monomeric hemichrome and dimeric cyanomet hemoglobins from Caudina arenicola
关键词 keywords	OXYGEN TRANSPORT; OXYGEN TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1hlb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1hlb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1hlb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	17.23 Å
Rg（电子密度）	15.77 Å
总 Rg	17.00 Å
原子数	1568
残基数	157
排除体积	22868 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1hlb__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HEMOGLOBIN (DEOXY)
分子量 formula_weight	17584.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1901

XGGTLAIQAQGDLTLAQKKIVRKTWHQLMRNKTSFVTDVFIRIFAYDPSAQNKFPQMAGMSASQLRSSRQMQAHAIRVSSIMSEYVEELDSDILPELLATLARTHDLNKVGADHYNLFAKVLMEALQAELGSDFNEKTRDAWAKAFSVVQAVLLVKHG

来源 Source

来源生物 organism	Caudina arenicola
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7698

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	111

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1hlba_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.2 — Globins

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1hlbA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Globins

▶

晶胞边长 a length_a	45.740 Å
晶胞边长 b length_b	45.230 Å
晶胞边长 c length_c	40.920 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	104.40 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	5.000 Å
R 因子 r_factor	0.1500
R_work r_work	0.1500
R_free r_free	—

Structural analysis of monomeric hemichrome and dimeric cyanomet hemoglobins from Caudina arenicola

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMOGLOBIN (DEOXY)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1hlb__assembly_1__model_1

1hlb__assembly_1__model_1 | I(q)

1hlb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (5)

Structural analysis of monomeric hemichrome and dimeric cyanomet hemoglobins from Caudina arenicola

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMOGLOBIN (DEOXY)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1hlb__assembly_1__model_1

1hlb__assembly_1__model_1 | I(q)

1hlb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (5)