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1hp5

STREPTOMYCES PLICATUS BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE COMPLEXED WITH INTERMEDIATE ANALOUGE NAG-THIAZOLINE

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE

Streptomyces plicatus

UniProt O85361

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 CHLORIDE ION × 3 SULFATE ION × 1 3AR,5R,6S,7R,7AR-5-HYDROXYMETHYL-2-METHYL-5,6,7,7A-TETRAHYDRO-3AH-PYRANO[3,2-D]THIAZOLE-6,7-DIOL × 1 GLYCEROL × 2 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 CHLORIDE ION × 6 SULFATE ION × 2 3AR,5R,6S,7R,7AR-5-HYDROXYMETHYL-2-METHYL-5,6,7,7A-TETRAHYDRO-3AH-PYRANO[3,2-D]THIAZOLE-6,7-DIOL × 2 GLYCEROL × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1hp4 1hp5 1m01 1m03 1m04 5fcz 5fd0

共 7 个 assembly

同源二聚体
1hp4 1hp4 1hp5 1m01 1m03 1m04 5fcz 5fd0

共 8 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O85361_STRPL
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 9–512； UniProt 3–506

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1hp5
沉积日期 deposition_date2000-12-12
结构标题 titleSTREPTOMYCES PLICATUS BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE COMPLEXED WITH INTERMEDIATE ANALOUGE NAG-THIAZOLINE
关键词 keywordsglycosyl hydrolase, streptomyces plicatus, hexosaminidase, family 20, substrate assisted catalysis, TIM barrel, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1hp5__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1hp5__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1hp5__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）33.65 Å
Rg（电子密度）33.37 Å
总 Rg33.75 Å
原子数7795
残基数998
排除体积137500 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1hp5__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1hp5__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1hp5a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family familyc.1.8.6 — beta-N-acetylhexosaminidase catalytic domain
结构域编号 domain_idd1hp5a2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.2 — beta-N-acetylhexosaminidase-like domain
家族 Family familyd.92.2.1 — beta-N-acetylhexosaminidase domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1hp5A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — Glycosidases
结构域编号 domain_id1hp5A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology379 — Chitobiase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like
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7. 引用文献 (5)