Human immunodeficiency virus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 1 | ;DNA (5'-D(P*AP*CP*GP*CP*C)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | GAG_HV1LW |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 E； PDB构建体 1–18； UniProt 389–406 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 1hvo |
| 沉积日期 deposition_date | 1992-12-08 |
| 结构标题 title | ZINC-AND SEQUENCE-DEPENDENT BINDING TO NUCLEIC ACIDS BY THE N-TERMINAL ZINC FINGER DOMAIN OF THE HIV-1 NUCLEOCAPSID PROTEIN: NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX WITH THE PSI-SITE ANALOG, D/ACGCC |
| 关键词 keywords | DNA, ZINC FINGER DOMAIN, HIV-1 NUCLEOCAPSID PROTEIN, PSI-SITE ANALOG, Viral protein-DNA COMPLEX; Viral protein/DNA |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 7 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 9.40 Å |
| Rg（电子密度） | 8.36 Å |
| 总 Rg | 9.65 Å |
| 原子数 | 431 |
| 残基数 | 23 |
| 排除体积 | 3905 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1hvo__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 1hvo__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 1hvo__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 1hvo__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 1hvo__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 1hvo__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 1hvo__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 1hvo__assembly_1__model_8 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 1hvo__assembly_1__model_9 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 1hvo__assembly_1__model_10 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 1hvo__assembly_1__model_11 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 1hvo__assembly_1__model_12 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 1hvo__assembly_1__model_13 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 1hvo__assembly_1__model_14 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 1hvo__assembly_1__model_15 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d1hvoe_ |
| 类 Class class | g — Small proteins |
| 折叠类型 Fold fold | g.40 — Retrovirus zinc finger-like domains |
| 超家族 Superfamily superfamily | g.40.1 — Retrovirus zinc finger-like domains |
| 家族 Family family | g.40.1.1 — Retrovirus zinc finger-like domains |