1hw2

FADR-DNA COMPLEX: TRANSCRIPTIONAL CONTROL OF FATTY ACID METABOLISM IN ECHERICHIA COLI

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN

Escherichia coli

UniProt P0A8V6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 5'-D(*CP*GP*AP*TP*CP*TP*GP*GP*TP*CP*CP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*AP*TP*GP*CP*T)-3' × 1 5'-D(*G*CP*AP*TP*CP*TP*GP*GP*TP*CP*GP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*AP*TP*CP*GP*A)-3' × 1 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FADR_ECOLI
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–239; UniProt 1–239 作者链 B; PDB构建体 1–239; UniProt 1–239

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1hw2
沉积日期 deposition_date2001-01-09
结构标题 titleFADR-DNA COMPLEX: TRANSCRIPTIONAL CONTROL OF FATTY ACID METABOLISM IN ECHERICHIA COLI
关键词 keywordshelix-turn-helix, helix bundle, protein-DNA complex, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1hw2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1hw2__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1hw2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.32 Å
Rg(电子密度)25.56 Å
总 Rg26.44 Å
原子数4294
残基数482
排除体积73433 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1hw2__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1hw2a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain
家族 Family familya.4.5.6 — GntR-like transcriptional regulators
结构域编号 domain_idd1hw2a2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.78 — GntR ligand-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.78.1 — GntR ligand-binding domain-like
家族 Family familya.78.1.1 — GntR ligand-binding domain-like
结构域编号 domain_idd1hw2b1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain
家族 Family familya.4.5.6 — GntR-like transcriptional regulators
结构域编号 domain_idd1hw2b2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.78 — GntR ligand-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.78.1 — GntR ligand-binding domain-like
家族 Family familya.78.1.1 — GntR ligand-binding domain-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1hw2A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id1hw2A02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily530 — GntR ligand-binding domain-like
结构域编号 domain_id1hw2B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id1hw2B02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily530 — GntR ligand-binding domain-like

7. 引用文献 (1)