Methanocaldococcus jannaschii
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | 16S RRNA FRAGMENT × 1 SULFATE ION × 1 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | 16S RRNA FRAGMENT × 1 SULFATE ION × 3 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | RS8_METJA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 B； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 |
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| 条目编号 entry_id | 1i6u |
| 沉积日期 deposition_date | 2001-03-05 |
| 结构标题 title | RNA-PROTEIN INTERACTIONS: THE CRYSTAL STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEIN S8/RRNA COMPLEX FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII |
| 关键词 keywords | protein-RNA interactions, ribosome, ribosomal protein S8, RNA; RIBOSOME |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.92 Å |
| Rg（电子密度） | 19.02 Å |
| 总 Rg | 19.79 Å |
| 原子数 | 1812 |
| 残基数 | 162 |
| 排除体积 | 29669 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1i6ua_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.140 — Ribosomal protein S8 |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.140.1 — Ribosomal protein S8 |
| 家族 Family family | d.140.1.1 — Ribosomal protein S8 |
| 结构域编号 domain_id | d1i6ub_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.140 — Ribosomal protein S8 |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.140.1 — Ribosomal protein S8 |
| 家族 Family family | d.140.1.1 — Ribosomal protein S8 |
| 结构域编号 domain_id | 1i6uA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — |
| 结构域编号 domain_id | 1i6uA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1490 — Dna Ligase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 1i6uB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — |
| 结构域编号 domain_id | 1i6uB02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1490 — Dna Ligase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |