1ifj

MOLECULAR MODELS AND STRUCTURAL COMPARISONS OF NATIVE AND MUTANT CLASS I FILAMENTOUS BACTERIOPHAGES FF (FD, F1, M13), IF1 AND IKE

Method: FIBER DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INOVIRUS

Enterobacteria phage fd

UniProt P69539

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 55 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COATB_BPFD
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–50; UniProt 24–73

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ifj
沉积日期 deposition_date1994-01-31
结构标题 titleMOLECULAR MODELS AND STRUCTURAL COMPARISONS OF NATIVE AND MUTANT CLASS I FILAMENTOUS BACTERIOPHAGES FF (FD, F1, M13), IF1 AND IKE
关键词 keywordsVIRUS, Helical virus; VIRUS
实验方法 methodFIBER DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ifj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ifj__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ifj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)57.97 Å
Rg(电子密度)58.96 Å
总 Rg58.60 Å
原子数20350
残基数2750
排除体积369090 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ifj__assembly_1__model_1 helical (55) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1ifj__assembly_2__model_1 monomeric (1) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1ifj__assembly_3__model_1 monomeric (1) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1ifja_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.4 — Inovirus (filamentous phage) major coat protein
家族 Family familyh.1.4.1 — Inovirus (filamentous phage) major coat protein

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1ifjA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80

7. 引用文献 (5)