1ihv

SOLUTION STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF HIV-1 INTEGRASE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HIV-1 INTEGRASE

Human immunodeficiency virus 1

UniProt P04586

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POL_HV1Z6
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–52; UniProt 80–130 作者链 B; PDB构建体 2–52; UniProt 80–130

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ihv
沉积日期 deposition_date1995-05-12
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF HIV-1 INTEGRASE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
关键词 keywordsDNA-BINDING PROTEIN, AIDS, POLYPROTEIN, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ihv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ihv__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ihv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)17.05 Å
Rg(电子密度)15.65 Å
总 Rg16.82 Å
原子数1770
残基数104
排除体积15569 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ihv__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1ihva_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.7 — DNA-binding domain of retroviral integrase
家族 Family familyb.34.7.1 — DNA-binding domain of retroviral integrase
结构域编号 domain_idd1ihvb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.7 — DNA-binding domain of retroviral integrase
家族 Family familyb.34.7.1 — DNA-binding domain of retroviral integrase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1ihvA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Integrase, C-terminal domain superfamily, retroviral
结构域编号 domain_id1ihvB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Integrase, C-terminal domain superfamily, retroviral

7. 引用文献 (1)