1itk

Crystal structure of catalase-peroxidase from Haloarcula marismortui

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

catalase-peroxidase

物种未注明

UniProt O59651

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 SULFATE ION × 6 CHLORIDE ION × 16 UNKNOWN ATOM OR ION × 6 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 SULFATE ION × 12 CHLORIDE ION × 32 UNKNOWN ATOM OR ION × 12 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CATA_HALMA
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–731; UniProt 1–731 作者链 B; PDB构建体 1–731; UniProt 1–731

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1itk
沉积日期 deposition_date2002-01-18
结构标题 titleCrystal structure of catalase-peroxidase from Haloarcula marismortui
关键词 keywordsHEME PROTEIN, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1itk__assembly_1__model_1 dimeric (2) 排除
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
2 1 1itk__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 排除
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1itka1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.93 — Heme-dependent peroxidases
超家族 Superfamily superfamilya.93.1 — Heme-dependent peroxidases
家族 Family familya.93.1.3 — Catalase-peroxidase KatG
结构域编号 domain_idd1itka2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.93 — Heme-dependent peroxidases
超家族 Superfamily superfamilya.93.1 — Heme-dependent peroxidases
家族 Family familya.93.1.3 — Catalase-peroxidase KatG
结构域编号 domain_idd1itkb1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.93 — Heme-dependent peroxidases
超家族 Superfamily superfamilya.93.1 — Heme-dependent peroxidases
家族 Family familya.93.1.3 — Catalase-peroxidase KatG
结构域编号 domain_idd1itkb2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.93 — Heme-dependent peroxidases
超家族 Superfamily superfamilya.93.1 — Heme-dependent peroxidases
家族 Family familya.93.1.3 — Catalase-peroxidase KatG

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id1itkA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology520 — Peroxidase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1itkA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology420 — Peroxidase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Peroxidase, domain 2
结构域编号 domain_id1itkA03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology520 — Peroxidase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1itkA04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology420 — Peroxidase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Peroxidase, domain 2
结构域编号 domain_id1itkB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology520 — Peroxidase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1itkB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology420 — Peroxidase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Peroxidase, domain 2
结构域编号 domain_id1itkB03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology520 — Peroxidase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1itkB04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology420 — Peroxidase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Peroxidase, domain 2

7. 引用文献 (1)