1ivv

Crystal structure of copper amine oxidase from Arthrobacter globiformis: Early intermediate in topaquinone biogenesis

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phenylethylamine oxidase

Arthrobacter globiformis

UniProt P46881

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–638 链 B; UniProt 1–638 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CU COPPER (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:MICRODIALYSIS;pH 6.8;293 K;potassium sodium tartrate, pH 6.8, MICRODIALYSIS, temperature 293K 分辨率 2.10 Å R-free 0.263

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 105 个其他 PDB 条目、143 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PAOX_ARTGO
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–638; UniProt 1–638 作者链 B; PDB构建体 1–638; UniProt 1–638

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ivv
沉积日期 deposition_date2002-03-29
结构标题 titleCrystal structure of copper amine oxidase from Arthrobacter globiformis: Early intermediate in topaquinone biogenesis
关键词 keywordsOxidoreductase, Amine oxidase, Biogenesis, TPQ, Freeze-trapp, Intermediate, Quinone cofactor, DAH; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1ivva1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.30 — Supersandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.30.2 — Amine oxidase catalytic domain
家族 Family familyb.30.2.1 — Amine oxidase catalytic domain
结构域编号 domain_idd1ivva2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.2 — Amine oxidase N-terminal region
家族 Family familyd.17.2.1 — Amine oxidase N-terminal region
结构域编号 domain_idd1ivva3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.2 — Amine oxidase N-terminal region
家族 Family familyd.17.2.1 — Amine oxidase N-terminal region
结构域编号 domain_idd1ivvb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.30 — Supersandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.30.2 — Amine oxidase catalytic domain
家族 Family familyb.30.2.1 — Amine oxidase catalytic domain
结构域编号 domain_idd1ivvb2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.2 — Amine oxidase N-terminal region
家族 Family familyd.17.2.1 — Amine oxidase N-terminal region
结构域编号 domain_idd1ivvb3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.2 — Amine oxidase N-terminal region
家族 Family familyd.17.2.1 — Amine oxidase N-terminal region

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1ivvA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1ivvA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1ivvA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology98 — Beta-galactosidase; Chain A, domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Copper amine oxidase, catalytic domain
结构域编号 domain_id1ivvB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1ivvB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1ivvB03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology98 — Beta-galactosidase; Chain A, domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Copper amine oxidase, catalytic domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (0)