Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | 5'-D(*TP*GP*TP*TP*AP*TP*CP*CP*AP*CP*AP*GP*G)-3' × 1 5'-D(*CP*CP*TP*GP*TP*GP*GP*AP*TP*AP*AP*CP*A)-3' × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | DNAA_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–94； UniProt 374–467 |
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| 条目编号 entry_id | 1j1v |
| 沉积日期 deposition_date | 2002-12-18 |
| 结构标题 title | Crystal structure of DnaA domainIV complexed with DnaAbox DNA |
| 关键词 keywords | ;Protein-DNA complex, Replication, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative, RSGI, Structural Genomics, replication-DNA COMPLEX ;; replication/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.86 Å |
| Rg（电子密度） | 15.79 Å |
| 总 Rg | 16.68 Å |
| 原子数 | 1279 |
| 残基数 | 118 |
| 排除体积 | 21067 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1j1va_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.4.12 — TrpR-like |
| 家族 Family family | a.4.12.2 — Chromosomal replication initiation factor DnaA C-terminal domain IV |
| 结构域编号 domain_id | 1j1vA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1750 — Chromosomal Replication Initiator Protein Dnaa; Chain: A; |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DnaA protein, C-terminal DNA-binding domain |