1j47

3D Solution NMR Structure of the M9I Mutant of the HMG-Box Domain of the Human Male Sex Determining Factor SRY Complexed to DNA

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SEX-DETERMINING REGION Y PROTEIN

Homo sapiens

UniProt Q05066

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*CP*CP*TP*GP*CP*AP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*CP*C)-3' × 1 5'-D(*GP*GP*TP*GP*TP*TP*TP*GP*TP*GP*CP*AP*GP*G)-3' × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SRY_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–85; UniProt 57–140

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1j47
沉积日期 deposition_date2001-07-23
结构标题 title3D Solution NMR Structure of the M9I Mutant of the HMG-Box Domain of the Human Male Sex Determining Factor SRY Complexed to DNA
关键词 keywords;MALE SEX DETERMINING FACTOR, SRY, SEX-REVERSAL MUTATION, DNA BENDING MUTANT, DIPOLAR COUPLINGS, MULTIDIMENSIONAL NMR, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX ;; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1j47__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1j47__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1j47__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.29 Å
Rg(电子密度)17.71 Å
总 Rg18.64 Å
原子数2401
残基数113
排除体积21618 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1j47__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1j47a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.21 — HMG-box
超家族 Superfamily superfamilya.21.1 — HMG-box
家族 Family familya.21.1.1 — HMG-box
结构域编号 domain_idd1j47a2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1j47A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain

7. 引用文献 (1)